RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021424.4

Sptlc2-201, Transcript of Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sptlc2, Length 6,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Znf428Q8C1M2 176 aa18.16■□□□□ 0.5
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Serpina10Q8R121 448 aa18.16■□□□□ 0.5
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Jakmip1Q8BVL9 626 aa18.15■□□□□ 0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Zfp644E9QA22 1323 aa18.15■□□□□ 0.5
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cnnm3Q32NY4 713 aa18.14■□□□□ 0.5
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cdk19Q8BWD8 501 aa18.14■□□□□ 0.49
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Eif5P59325 429 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fsd1Q7TPM6 496 aa18.14■□□□□ 0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 SkilQ60665 675 aa18.13■□□□□ 0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Plekhd1B2RPU2 505 aa18.13■□□□□ 0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rnf216P58283 853 aa18.13■□□□□ 0.49
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Psmd1Q3TXS7 953 aa18.12■□□□□ 0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa18.12■□□□□ 0.49
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Stim1P70302 685 aa18.11■□□□□ 0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tnni2P13412 182 aa18.1■□□□□ 0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Arhgap5P97393 1501 aa18.1■□□□□ 0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Wdhd1P59328 1117 aa18.09■□□□□ 0.49
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 TnmdQ9EP64 317 aa18.09■□□□□ 0.49
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Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fsd2Q8BZ52 692 aa18.09■□□□□ 0.49
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