RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 SNX15Q9NRS6 342 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 TNNQ9UQP3 1299 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 PIK3C2BO00750 1634 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa5.66□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 NSD3Q9BZ95 1437 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 LMTK3Q96Q04 1460 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 ZNF213O14771 459 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 CA12O43570 354 aa5.65□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 DNASE1L3Q13609 305 aa5.65□□□□□ -1.5
TRDN-204ENST00000542443 PRKG1Q13976 671 aa5.65□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.65□□□□□ -1.5
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TRDN-204ENST00000542443 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa5.64□□□□□ -1.51
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TRDN-204ENST00000542443 FAM90A15PP0C7V4 464 aa5.64□□□□□ -1.51
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TRDN-204ENST00000542443 KIRREL2Q6UWL6 708 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-204ENST00000542443 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-204ENST00000542443 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TRDN-204ENST00000542443 LINC01465Q8N7H1 131 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-204ENST00000542443 SARAFQ96BY9 339 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-204ENST00000542443 MCRS1Q96EZ8 462 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-204ENST00000542443 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TRDN-204ENST00000542443 SCLT1Q96NL6 688 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-204ENST00000542443 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-204ENST00000542443 KCNK9Q9NPC2 374 aa5.63□□□□□ -1.51
TRDN-204ENST00000542443 VPS45Q9NRW7 570 aa5.63□□□□□ -1.51
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