RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 CEP250Q9BV73 2442 aa18.92■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 CAPN9O14815 690 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 TULP3O75386 442 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 APODP05090 189 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 NCAM1P13591 858 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 PSMA2P25787 234 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 COG7P83436 770 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 ACAP1Q15027 740 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 SLC25A52Q3SY17 297 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 SYPL2Q5VXT5 272 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 PRR23BQ6ZRT6 265 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 DAAM2Q86T65 1068 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 KIAA2013Q8IYS2 634 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 SYCE1Q8N0S2 351 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 EDEM1Q92611 657 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 P2RY11Q96G91 374 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 CFAP57Q96MR6 1250 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 NPY6RQ99463 290 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 MARK1Q9P0L2 795 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 MARCH2Q9P0N8 246 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 STAP1Q9ULZ2 295 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 LAMA1P25391 3075 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 TRIM24O15164 1050 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 SLC1A1P43005 524 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 ZNF569Q5MCW4 686 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 EMC10Q5UCC4 262 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 LAIR1Q6GTX8 287 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 MSANTD2Q6P1R3 559 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 TPGS1Q6ZTW0 290 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 BNIPLQ7Z465 357 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 GOLPH3Q9H4A6 298 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 DEC1Q9P2X7 70 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 RAB23Q9ULC3 237 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 MMP17Q9ULZ9 603 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 ALG6Q9Y672 507 aa18.91■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 CACNG3O60359 315 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 ENDOD1O94919 500 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 APBB3O95704 486 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 HMBSP08397 361 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 TYRP14679 529 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 TGM1P22735 817 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 TNFRSF4P43489 277 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 GNG11P61952 73 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 ETF1P62495 437 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 STRADAQ7RTN6 431 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 IL17RCQ8NAC3 791 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 GAB3Q8WWW8 586 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 BBS2Q9BXC9 721 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 ADAM33Q9BZ11 813 aa18.9■□□□□ 0.62
PTX4-201ENST00000293922 SLC12A8A0AV02 714 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 IGLV3-25P01717 112 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 DESP17661 470 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 COMTP21964 271 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 PCK1P35558 622 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 TIE1P35590 1138 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 NT5DC3Q86UY8 548 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 SLC35F6Q8N357 371 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 ALLCQ8N6M5 410 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 TERB1Q8NA31 727 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 RNF139Q8WU17 664 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 TBCBQ99426 244 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 NCAPGQ9BPX3 1015 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 DCLK3Q9C098 648 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 EBF1Q9UH73 591 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 GMEB2Q9UKD1 530 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.89■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D3BA6NDS4 549 aa18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 AXIN1O15169 862 aa18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 LRCH4O75427 683 aa18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 RPP40O75818 363 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 RNF8O76064 485 aa18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 TUBB4AP04350 444 aa18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 SULT1E1P49888 294 aa18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 ATP11AP98196 1134 aa18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 CRY1Q16526 586 aa18.88■□□□□ 0.61
PTX4-201ENST00000293922 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms