RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477334.1

RBM39-231, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 949 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-231	ENST00000477334	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334		H3BNC9	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	DUSP1	P28562	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	POLE2	P56282	527 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63	2e-42	■■■□□ 16.7
RBM39-231	ENST00000477334	GAB1	Q13480	694 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CBFB	Q13951	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RUBCN	Q92622	972 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FAR2	Q96K12	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	VPS16	Q9H269	839 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	MATN1	P21941	496 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	TUBA4A	P68366	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	NELL1	Q92832	810 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RBM39-231	ENST00000477334	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	NKX2-8	O15522	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	LMO1	P25800	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	VPS41	P49754	854 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	AGTR2	P50052	363 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	PRKAA2	P54646	552 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	TAF5	Q15542	800 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	CNGA3	Q16281	694 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RBM39-231	ENST00000477334	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.9 ms