RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274721.7

GFRA3-201, Transcript of GDNF family receptor alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3-201ENST00000274721 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 DDIT4Q9NX09 232 aa22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ADAM28Q9UKQ2 775 aa22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 VWA8A3KMH1 1905 aa22.12■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 H3BRJ5 948 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 DGKIO75912 1065 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ACTN2P35609 894 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SLCO1A2P46721 670 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 CXCR3P49682 368 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 PPP2R2AP63151 447 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 DPYSQ14117 519 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 KCNJ11Q14654 390 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 LONRF1Q17RB8 773 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 AMHP03971 560 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 GATMP50440 423 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SLC5A3P53794 718 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SMIM23A6NLE4 172 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 CHADO15335 359 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 GCATO75600 419 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ALDH2P05091 517 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 GRIK1P39086 918 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 HCAR3P49019 387 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ARL4CP56559 192 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 GNGT1P63211 74 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 STAT4Q14765 748 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 MSS51Q4VC12 460 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FNBP1LQ5T0N5 605 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 C4orf22Q6V702 233 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 RFX8Q6ZV50 586 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SCLYQ96I15 445 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SCN5AQ14524 2016 aa22.1■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FAM72CH0Y354 149 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 IGLV3-25P01717 112 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 MAGEA6P43360 314 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FAM72BQ86X60 149 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 HIPK3Q9H422 1215 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 MARCH5Q9NX47 278 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 HACD1B0YJ81 288 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 DCLK1O15075 740 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 HOXA2O43364 376 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 CREB3O43889 395 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 GUCY1A3Q02108 690 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FAAP100Q0VG06 881 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 VSTM1Q6UX27 236 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 TOX2Q96NM4 488 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 WDCPQ9H6R7 721 aa22.09■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 C5orf60A6NFR6 353 aa22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FGFR3P22607 806 aa22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 MMP13P45452 471 aa22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 SLC11A1P49279 550 aa22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 LRRC31Q6UY01 552 aa22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 TAC4Q86UU9 113 aa22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 CCDC77Q9BR77 488 aa22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.08■■□□□ 1.13
GFRA3-201ENST00000274721 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.08■■□□□ 1.13
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