RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639658.1

POLR2B-213, Transcript of RNA polymerase II subunit B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene POLR2B, Length 3,300 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2B-213ENST00000639658 LAPTM5Q13571 262 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 MORF4L2Q15014 288 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CYTH1Q15438 398 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 C4orf46Q504U0 113 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 LPCAT4Q643R3 524 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 PTF1AQ7RTS3 328 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 APOPT1Q96IL0 206 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CEP295NLQ96MC4 621 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 SAMD11Q96NU1 681 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 KCNK16Q96T55 309 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 DNAJC28Q9NX36 388 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 MYRFQ9Y2G1 1151 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 ISPDA4D126 451 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 GOLGA8OA6NCC3 632 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 GOLGA8NF8WBI6 632 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 H3BMQ9 156 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 GOLGA8RI6L899 631 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 PDXKO00764 312 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 USP1O94782 785 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 ACSL3O95573 720 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 ANXA1P04083 346 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 SERPINB2P05120 415 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CES1P23141 567 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 MCM7P33993 719 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 PCYT1AP49585 367 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CTBSQ01459 385 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 DUSP7Q16829 419 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CAVIN4Q5BKX8 364 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 GGT6Q6P531 493 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 USP43Q70EL4 1123 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 KRT25Q7Z3Z0 450 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 RIOX2Q8IUF8 465 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 FLAD1Q8NFF5 587 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 ZUFSPQ96AP4 578 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CMTM5Q96DZ9 223 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CALML4Q96GE6 196 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 SCYL1Q96KG9 808 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 COG8Q96MW5 612 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CDRT15Q96T59 188 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 TTC1Q99614 292 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 TRIM31Q9BZY9 425 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 ANKHQ9HCJ1 492 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 OSGEPQ9NPF4 335 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 SCUBE2Q9NQ36 999 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CLUHO75153 1309 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 ILVBLA1L0T0 632 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 KLRF2D3W0D1 207 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 H3BRJ5 948 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 KPNA6O60684 536 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CHEK2O96017 543 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 LDHCP07864 332 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 GPD2P43304 727 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CBX5P45973 191 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 SLC5A3P53794 718 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 PEX3P56589 373 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 STILQ15468 1287 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 LRRC24Q50LG9 513 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 C6orf183Q5T699 404 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 FAM117BQ6P1L5 589 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 FAM122CQ6P4D5 195 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 ZNF790Q6PG37 636 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 PPM1KQ8N3J5 372 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 S100ZQ8WXG8 99 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 TAMM41Q96BW9 452 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CNDP1Q96KN2 507 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 GDF15Q99988 308 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 RTKNQ9BST9 563 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 ISCA1Q9BUE6 129 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 NAPBQ9H115 298 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 SERHL2Q9H4I8 314 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 ACSS3Q9H6R3 686 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 SCINQ9Y6U3 715 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 A0A1W2PRG0 241 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 CCDC160A6NGH7 325 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR2B-213ENST00000639658 SMIM23A6NLE4 172 aa5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms