RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473565.5

CLK1-210, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLK1, Length 3,208 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-210ENST00000473565 SH3GL2Q99962 352 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 MED4Q9NPJ6 270 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.5□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
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CLK1-210ENST00000473565 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.49□□□□□ -1.37
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CLK1-210ENST00000473565 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.49□□□□□ -1.37
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CLK1-210ENST00000473565 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 TLDC2A0PJX2 215 aa6.48□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 FOXO6A8MYZ6 492 aa6.48□□□□□ -1.37
CLK1-210ENST00000473565 DAB1O75553 588 aa6.48□□□□□ -1.37
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