RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANO4Q32M45 955 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EOGTQ5NDL2 527 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HTR3DQ70Z44 454 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM25Q86YD3 366 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHTF2Q8N3S3 785 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MDGA1Q8NFP4 955 aa27.63■■■□□ 2.01
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RXFP3Q9NSD7 469 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEC1Q9P2X7 70 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D3BA6NDS4 549 aa27.62■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGK1O00141 431 aa27.62■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TULP3O75386 442 aa27.62■■■□□ 2.01
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa27.62■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OSER1Q9NX31 292 aa27.62■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMS2CLQ68D20 193 aa27.61■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT18Q6ZVK8 323 aa27.61■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EEF2KMTQ96G04 330 aa27.61■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NMUR1Q9HB89 426 aa27.61■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa27.61■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RMND1Q9NWS8 449 aa27.61■■■□□ 2.01
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PQH9 124 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CETN3O15182 167 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STX10O60499 249 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAVIN2O95810 425 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADRB1P08588 477 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPB41P11171 864 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RARGP13631 454 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MXI1P50539 228 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNOCQ13519 176 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF394Q53GI3 561 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STPG1Q5TH74 334 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXL13Q8NEE6 735 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA4DQ92854 862 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAXDC2Q96IV6 333 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUSP16Q9BY84 665 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GREM1O60565 184 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNA4P22459 653 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF11P52732 1056 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCEAL6Q6IPX3 200 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHDC10Q6PID8 442 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC39CQ8N584 583 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TERB1Q8NA31 727 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OLIG1Q8TAK6 271 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNV2Q8TDN2 545 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCEAL3Q969E4 200 aa27.59■■■□□ 2.01
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB20Q9NX57 234 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNMT3LQ9UJW3 386 aa27.59■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAM23O75077 832 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCKDHBP21953 392 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSEN1P49768 467 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf120Q5SQS8 335 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf76Q5T2E6 689 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC186Q7Z3E2 898 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CISHQ9NSE2 258 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAGPAQ9UK23 515 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT5Q9UKK9 219 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLA2G4AP47712 749 aa27.57■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRAMD4Q6IC98 578 aa27.57■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TADA2BQ86TJ2 420 aa27.57■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCA7Q8IZY2 2146 aa27.57■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPACA7Q96KW9 195 aa27.57■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BBS2Q9BXC9 721 aa27.57■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR35Q9P2L0 1181 aa27.57■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMA1P25391 3075 aa27.57■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM4SF5O14894 197 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MDM4O15151 490 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM24O15164 1050 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P2RY2P41231 377 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRCPP42785 496 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF43Q68DV7 783 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPGS1Q6ZTW0 290 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2U1Q7Z449 544 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCD5Q86SK9 330 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGBD3Q8N328 593 aa27.56■■■□□ 2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMGB4Q8WW32 186 aa27.56■■■□□ 2
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