RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCOCQ9UIL1 159 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PRSS2P07478 247 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD48P09326 243 aa-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM72DQ6L9T8 149 aa-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM72BQ86X60 149 aa-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ATG4AQ8WYN0 398 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 GLG1Q92896 1179 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 LGALS12Q96DT0 336 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL17FQ96PD4 163 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 FIZ1Q96SL8 496 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 IMPG2Q9BZV3 1241 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 MS4A5Q9H3V2 200 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDZD7Q9H5P4 517 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 NYAP2Q9P242 653 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 MSRAQ9UJ68 235 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCNX3Q9H6A9 2034 aa-0.2□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa-0.21□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 FGD2Q7Z6J4 655 aa-0.21□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 C7orf57Q8NEG2 295 aa-0.21□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 F2RL3Q96RI0 385 aa-0.21□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 VGLL1Q99990 258 aa-0.21□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CD40P25942 277 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 DRG2P55039 364 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
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RNU6-871P-201ENST00000516122 RAE1P78406 368 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC14A1Q13336 389 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 PEX6Q13608 980 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEPT2Q15019 361 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC39A14Q15043 492 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNAI3Q3KNW1 292 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM61Q5EBN2 209 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM65Q6PI78 240 aa-0.22□□□□□ -2.44
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