RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa18.75■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 SEMA4DQ92854 862 aa18.75■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 SMARCE1Q969G3 411 aa18.75■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 LOXL4Q96JB6 756 aa18.75■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.75■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 TLR5O60602 858 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 ADORA2BP29275 332 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 LPAL2Q16609 132 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 ANKRD40Q6AI12 368 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CEP68Q76N32 757 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 USP33Q8TEY7 942 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 EEF2KMTQ96G04 330 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PNKPQ96T60 521 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 DUSP16Q9BY84 665 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 UBXN6Q9BZV1 441 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PARD6AQ9NPB6 346 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.591e-56■■■■■ 327
HDDC3-201ENST00000330334 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.74■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 RPP40O75818 363 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 APBB3O95704 486 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CD58P19256 250 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 HOXC13P31276 330 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PPP1R2P41236 205 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PGFP49763 221 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PSEN1P49768 467 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 KIF11P52732 1056 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 DMC1Q14565 340 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 HTR3DQ70Z44 454 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CISHQ9NSE2 258 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 USP18Q9UMW8 372 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 USP3Q9Y6I4 520 aa18.73■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 AXIN1O15169 862 aa18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 ADH5P11766 374 aa18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 ACO1P21399 889 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 GRIA2P42262 883 aa18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 TNFRSF4P43489 277 aa18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PMS1P54277 932 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 GAD2Q05329 585 aa18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CSRP2Q16527 193 aa18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 LY6G5CQ5SRR4 150 aa18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 FOXR2Q6PJQ5 311 aa18.72■□□□□ 0.59
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HDDC3-201ENST00000330334 KCNV2Q8TDN2 545 aa18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM176AQ96HP8 235 aa18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 NACA2Q9H009 215 aa18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PSMA7O14818 248 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PMM2O15305 246 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 GREM1O60565 184 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 KAT7O95251 611 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 SLC6A11P48066 632 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 PXNP49023 591 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 RAD23BP54727 409 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 GOLGA8FQ08AF8 430 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 SPEM2Q0P670 501 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 STIM1Q13586 685 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CBWD6Q4V339 395 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CBWD3Q5JTY5 395 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CBWD5Q5RIA9 395 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 ARHGAP17Q68EM7 881 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 TADA2BQ86TJ2 420 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 SLC4A11Q8NBS3 891 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 SPHK2Q9NRA0 654 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 SEMA4GQ9NTN9 838 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 OSER1Q9NX31 292 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 MMP17Q9ULZ9 603 aa18.71■□□□□ 0.59
HDDC3-201ENST00000330334 CYP26A1O43174 497 aa18.7■□□□□ 0.58
HDDC3-201ENST00000330334 TBX18O95935 607 aa18.7■□□□□ 0.58
HDDC3-201ENST00000330334 APODP05090 189 aa18.7■□□□□ 0.58
HDDC3-201ENST00000330334 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HDDC3-201ENST00000330334 PLA2G4AP47712 749 aa18.7■□□□□ 0.58
HDDC3-201ENST00000330334 TCERG1LQ5VWI1 586 aa18.7■□□□□ 0.58
HDDC3-201ENST00000330334 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.7■□□□□ 0.58
HDDC3-201ENST00000330334 BBS7Q8IWZ6 715 aa18.7■□□□□ 0.58
HDDC3-201ENST00000330334 PHTF2Q8N3S3 785 aa18.7■□□□□ 0.58
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