RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	SGD1	Q06132	899 aa		5.75	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	IOC2	Q12072	812 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	LYS2	P07702	1392 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	FLO11	P08640	1367 aa		5.74	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	FBP1	P09201	348 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	ASH1	P34233	588 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	GSC2	P40989	1895 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	PAH1	P32567	862 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.72	□□□□□ -1.49	not detected
YNL057W	YNL057W	FCP1	Q03254	732 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	UBX2	Q04228	584 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	DPH6	Q12429	685 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YNL057W	YNL057W	SPL2	P38839	148 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	ICP55	P40051	511 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	MGA2	P40578	1113 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	YBR287W	P38355	427 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	VPS29	P38759	282 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	YNL050C	P53952	270 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	PEX29	Q03370	554 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	TOS4	Q06266	489 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	COQ4	O13525	335 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	NIT1	P40447	199 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	SPR3	P41901	512 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	MTC3	P53077	123 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	ULP1	Q02724	621 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	YOL036W	Q08206	761 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	GAL2	P13181	574 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	MGM1	P32266	881 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	CLA4	P48562	842 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	THI3	Q07471	609 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	BMT6	Q12291	365 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	PSF2	P40359	213 aa		5.67	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	ARG82	P07250	355 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.66	□□□□□ -1.5	not detected
YNL057W	YNL057W	STS1	P38637	319 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	IRC4	Q03036	179 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	GIN4	Q12263	1142 aa		5.66	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	DLD1	P32891	587 aa		5.65	□□□□□ -1.5
YNL057W	YNL057W	RTG1	P32607	177 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	YOL057W	Q08225	711 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	SWI1	P09547	1314 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	IXR1	P33417	597 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	LDH1	P38139	375 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	MAM1	P40065	302 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	JJJ2	P46997	583 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	VPS62	P53285	467 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	DNM1	P54861	757 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	PPM2	Q08282	695 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	SAM3	Q08986	587 aa		5.63	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	NUP133	P36161	1157 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	ERG7	P38604	731 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	ITC1	P53125	1264 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	SRC1	Q03707	834 aa		5.62	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	PRD1	P25375	712 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	CST6	P40535	587 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	ATG1	P53104	897 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	EAR1	Q03212	550 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	PSH1	Q12161	406 aa		5.61	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	NCR1	Q12200	1170 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	FLO1	P32768	1537 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	SAC3	P46674	1301 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	RAD53	P22216	821 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	SEC61	P32915	480 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	FIR1	P40020	876 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	PUS6	P53294	404 aa		5.59	□□□□□ -1.51
YNL057W	YNL057W	NET1	P47035	1189 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	GYP7	P48365	746 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	IOC4	Q04213	475 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	ADR1	P07248	1323 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.57	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	MRP7	P12687	371 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	MCD4	P36051	919 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	YFH7	P43591	353 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	YJR008W	P47085	338 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	THI22	Q06490	572 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	YDR306C	Q06640	478 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	RTT109	Q07794	436 aa		5.57	□□□□□ -1.52
YNL057W	YNL057W	PSF3	Q12146	194 aa		5.57	□□□□□ -1.52

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.7 ms