RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A GIS4Q04233 774 aa6.43□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A AI3P03877 415 aa6.42□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A KAP122P32767 1081 aa6.42□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A RRM3P38766 723 aa6.42□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A UTP4Q06679 776 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A SAC7P17121 654 aa6.41□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A PEP12P32854 288 aa6.41□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A APM2P38700 605 aa6.41□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A KTR7P40504 517 aa6.41□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A ACS2P52910 683 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A GAS5Q08193 484 aa6.41□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A PGM1P33401 570 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A SCD5P34758 872 aa6.4□□□□□ -1.38
YHL009W-AYHL009W-A YNR040WP53736 256 aa6.39□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A PHO87P25360 923 aa6.38□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A HAP4P14064 554 aa6.37□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A AVT1P47082 602 aa6.37□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A HXT5P38695 592 aa6.36□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A ARI1P53111 347 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A UBP1P25037 809 aa6.35□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A NGR1P32831 672 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A HGH1P48362 394 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A GAS4Q08271 471 aa6.35□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A RPC31P17890 251 aa6.34□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A COQ2P32378 372 aa6.34□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A SFA1P32771 386 aa6.34□□□□□ -1.39
YHL009W-AYHL009W-A MRP10O75012 95 aa6.32□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A KAE1P36132 386 aa6.32□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A QDR2P40474 542 aa6.32□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A AOS1Q06624 347 aa6.32□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A MED7Q08278 222 aa6.31□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A SLP1Q12232 587 aa6.3□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A TRP3P00937 484 aa6.29□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A IDI1P15496 288 aa6.29□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A RSC6P25632 483 aa6.29□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A ROM1P53046 1155 aa6.29□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A VAN1P23642 535 aa6.28□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A ELM1P32801 640 aa6.28□□□□□ -1.4
YHL009W-AYHL009W-A TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa6.27□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A GAL2P13181 574 aa6.27□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A LIP5P32875 414 aa6.27□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A YKR073CP36153 106 aa6.27□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A CWH41P53008 833 aa6.27□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A ITC1P53125 1264 aa6.27□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A YLR122CQ12312 125 aa6.27□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A TY4A-HQ6Q5P6 413 aa6.27□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A TED1P40533 473 aa6.26□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A GIP2P40036 548 aa6.25□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A YER156CP40093 338 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A SIS2P36024 562 aa6.24□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A TOS1P38288 455 aa6.24□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A SAF1P38352 637 aa6.24□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A YOR296WQ08748 1289 aa6.24□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A CHS2P14180 963 aa6.23□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A VMA3P25515 160 aa6.23□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A YGR130CP53278 816 aa6.23□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A SOK2P53438 785 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A TRS33Q99394 268 aa6.22□□□□□ -1.41
YHL009W-AYHL009W-A DYS1P38791 387 aa6.21□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A DSE4P53753 1117 aa6.21□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A CAB1Q04430 367 aa6.21□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A MRPL33P20084 86 aa6.2□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data6.2□□□□□ -1.42not detected
YHL009W-AYHL009W-A GIP1P38229 639 aa6.2□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A AKR1P39010 764 aa6.2□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A YJL181WP46987 611 aa6.2□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A CTH1P47976 325 aa6.2□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A FOX2Q02207 900 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A RSC2Q06488 889 aa6.2□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A NAM7P30771 971 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A SUV3P32580 737 aa6.19□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A BSD2P38356 321 aa6.19□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A ECM23Q02710 187 aa6.19□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A BRE4Q07660 1125 aa6.19□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A LDH1P38139 375 aa6.18□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A TGL4P36165 910 aa6.17□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data6.17□□□□□ -1.42not detected
YHL009W-AYHL009W-A ISW1P38144 1129 aa6.16□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A CYC7P00045 113 aa6.15□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A YBR197CP38306 217 aa6.15□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A PPT1P53043 513 aa6.15□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A REC8Q12188 680 aa6.15□□□□□ -1.42
YHL009W-AYHL009W-A UBX7P38349 436 aa6.14□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A YIL165CP40446 119 aa6.13□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A SPO74P45819 413 aa6.13□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A MAG2Q06436 670 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A PAN5P38787 379 aa6.11□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A INP51P40559 946 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A MSN1P22148 382 aa6.1□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A ISC10P32645 267 aa6.09□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A TTI1P36097 1038 aa6.09□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A UBP5P39944 805 aa6.09□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A ALD4P46367 519 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A GUP1P53154 560 aa6.09□□□□□ -1.43
YHL009W-AYHL009W-A YBR287WP38355 427 aa6.08□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A LEM3P42838 414 aa6.08□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A MSB1P21339 1137 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
YHL009W-AYHL009W-A MAE1P36013 669 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16 ms