RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639848.1

HLA-B-256, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, human

BASIC

Gene HLA-B, Length 1,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-B-256	ENST00000639848	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
HLA-B-256	ENST00000639848	JCAD	Q9P266	1359 aa		29.23	■■■□□ 2.27
HLA-B-256	ENST00000639848	PRAM1	Q96QH2	718 aa		29.21	■■■□□ 2.27
HLA-B-256	ENST00000639848	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		29.21	■■■□□ 2.27
HLA-B-256	ENST00000639848	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		29.18	■■■□□ 2.26
HLA-B-256	ENST00000639848	POGK	Q9P215	609 aa		29.17	■■■□□ 2.26
HLA-B-256	ENST00000639848	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		29.17	■■■□□ 2.26
HLA-B-256	ENST00000639848	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		29.16	■■■□□ 2.26
HLA-B-256	ENST00000639848	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		29.16	■■■□□ 2.26
HLA-B-256	ENST00000639848	ORAI2	Q96SN7	254 aa		29.15	■■■□□ 2.26
HLA-B-256	ENST00000639848	NEUROD1	Q13562	356 aa		29.14	■■■□□ 2.26
HLA-B-256	ENST00000639848	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	29.11	■■■□□ 2.25
HLA-B-256	ENST00000639848	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
HLA-B-256	ENST00000639848	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		29.11	■■■□□ 2.25
HLA-B-256	ENST00000639848	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		29.1	■■■□□ 2.25
HLA-B-256	ENST00000639848	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		29.1	■■■□□ 2.25
HLA-B-256	ENST00000639848	ADGRB2	O60241	1585 aa		29.09	■■■□□ 2.25
HLA-B-256	ENST00000639848	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
HLA-B-256	ENST00000639848	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
HLA-B-256	ENST00000639848	SHPRH	Q149N8	1683 aa		29.07	■■■□□ 2.24
HLA-B-256	ENST00000639848	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
HLA-B-256	ENST00000639848	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		29.06	■■■□□ 2.24
HLA-B-256	ENST00000639848	NUTM2F	A1L443	756 aa		29.05	■■■□□ 2.24
HLA-B-256	ENST00000639848	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		29.05	■■■□□ 2.24
HLA-B-256	ENST00000639848	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		29.03	■■■□□ 2.24
HLA-B-256	ENST00000639848	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
HLA-B-256	ENST00000639848	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
HLA-B-256	ENST00000639848	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	ILDR2	Q71H61	639 aa		29	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		29	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28.99	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	KIF1A	Q12756	1690 aa		28.99	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	FOXO3	O43524	673 aa		28.98	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	PXDN	Q92626	1479 aa		28.97	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	LRP6	O75581	1613 aa		28.97	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		28.96	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		28.95	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		28.95	■■■□□ 2.23
HLA-B-256	ENST00000639848	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		28.93	■■■□□ 2.22
HLA-B-256	ENST00000639848	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
HLA-B-256	ENST00000639848	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
HLA-B-256	ENST00000639848	USP32	Q8NFA0	1604 aa		28.91	■■■□□ 2.22
HLA-B-256	ENST00000639848	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
HLA-B-256	ENST00000639848	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.9	■■■□□ 2.22
HLA-B-256	ENST00000639848	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
HLA-B-256	ENST00000639848	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		28.9	■■■□□ 2.22
HLA-B-256	ENST00000639848	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		28.89	■■■□□ 2.22
HLA-B-256	ENST00000639848	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		28.88	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		28.88	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	PSME1	Q06323	249 aa		28.86	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	CDK19	Q9BWU1	502 aa		28.85	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		28.85	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	ATP7B	P35670	1465 aa		28.85	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		28.83	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	SBNO1	A3KN83	1393 aa		28.83	■■■□□ 2.21
HLA-B-256	ENST00000639848	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		28.82	■■■□□ 2.2
HLA-B-256	ENST00000639848	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		28.8	■■■□□ 2.2
HLA-B-256	ENST00000639848	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
HLA-B-256	ENST00000639848	POTEA	Q6S8J7	498 aa		28.79	■■■□□ 2.2
HLA-B-256	ENST00000639848	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		28.78	■■■□□ 2.2
HLA-B-256	ENST00000639848	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		28.77	■■■□□ 2.2
HLA-B-256	ENST00000639848	SOCS7	O14512	581 aa		28.77	■■■□□ 2.2
HLA-B-256	ENST00000639848	ITSN1	Q15811	1721 aa		28.77	■■■□□ 2.2
HLA-B-256	ENST00000639848	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		28.76	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		28.76	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	ARHGEF10	O15013	1369 aa		28.75	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	C8orf37	Q96NL8	207 aa		28.74	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	AFF2	P51816	1311 aa		28.73	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	ADAMTS2	O95450	1211 aa		28.73	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	EVC2	Q86UK5	1308 aa		28.72	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		28.72	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		28.72	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		28.71	■■■□□ 2.19
HLA-B-256	ENST00000639848	NGLY1	Q96IV0	654 aa		28.69	■■■□□ 2.18
HLA-B-256	ENST00000639848	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
HLA-B-256	ENST00000639848	CABP2	Q9NPB3	220 aa		28.68	■■■□□ 2.18
HLA-B-256	ENST00000639848	ACE	P12821	1306 aa		28.67	■■■□□ 2.18
HLA-B-256	ENST00000639848	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		28.66	■■■□□ 2.18
HLA-B-256	ENST00000639848	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
HLA-B-256	ENST00000639848	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		28.66	■■■□□ 2.18
HLA-B-256	ENST00000639848	ALS2	Q96Q42	1657 aa		28.62	■■■□□ 2.17
HLA-B-256	ENST00000639848	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
HLA-B-256	ENST00000639848	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
HLA-B-256	ENST00000639848	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
HLA-B-256	ENST00000639848	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
HLA-B-256	ENST00000639848	RXRB	P28702	533 aa		28.59	■■■□□ 2.17
HLA-B-256	ENST00000639848	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		28.59	■■■□□ 2.17
HLA-B-256	ENST00000639848	USP21	Q9UK80	565 aa		28.59	■■■□□ 2.17

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