RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 USP35Q9P2H5 1018 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF3AQ9Y496 699 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PTPRJ-208ENST00000615445 G3V3G9 751 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 BCAR3O75815 825 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 AKNAQ7Z591 1439 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 NCOA1Q15788 1441 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 PDE3AQ14432 1141 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 CD109Q6YHK3 1445 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 H3BQV1 296 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 IFFO2Q5TF58 517 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PTPRJ-208ENST00000615445 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.33■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 PHF14O94880 888 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 WDR63Q8IWG1 891 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 GNAI3P08754 354 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 RASSF8Q8NHQ8 419 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 CLSTN1O94985 981 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 TPM4P67936 248 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF14Q15058 1648 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGRL1O94910 1474 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 ERC2O15083 957 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-208ENST00000615445 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 GSE1Q14687 1217 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC4A2P04920 1241 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 APPP05067 770 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF20Q5VTR2 975 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CDC45O75419 566 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 MCTP1Q6DN14 999 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 MSH5O43196 834 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-208ENST00000615445 IDI1Q13907 227 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 FCHSD2O94868 740 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 WWC1Q8IX03 1113 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 VPS37DQ86XT2 251 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 CPLX1O14810 134 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRJ-208ENST00000615445 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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