RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-207ENST00000572043 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRAM1Q96QH2 718 aa25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 SOCS7O14512 581 aa25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 LAMC1P11047 1609 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIRT1Q96EB6 747 aa25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 POGKQ9P215 609 aa25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRP6O75581 1613 aa25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1-207ENST00000572043 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-207ENST00000572043 STAC3Q96MF2 364 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADGRB1O14514 1584 aa25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1-207ENST00000572043 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-207ENST00000572043 FOXO3O43524 673 aa25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1-207ENST00000572043 POTEAQ6S8J7 498 aa25.77■■□□□ 1.72
CTDNEP1-207ENST00000572043 NEUROD1Q13562 356 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-207ENST00000572043 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-207ENST00000572043 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-207ENST00000572043 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-207ENST00000572043 SHPRHQ149N8 1683 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-207ENST00000572043 DLC1Q96QB1 1528 aa25.75■■□□□ 1.71
CTDNEP1-207ENST00000572043 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-207ENST00000572043 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-207ENST00000572043 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-207ENST00000572043 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADAMTS2O95450 1211 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.68■■□□□ 1.7
CTDNEP1-207ENST00000572043 C8orf37Q96NL8 207 aa25.67■■□□□ 1.7
CTDNEP1-207ENST00000572043 PXDNQ92626 1479 aa25.66■■□□□ 1.7
CTDNEP1-207ENST00000572043 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.66■■□□□ 1.7
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-207ENST00000572043 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.64■■□□□ 1.7
CTDNEP1-207ENST00000572043 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-207ENST00000572043 AFF2P51816 1311 aa25.63■■□□□ 1.69
CTDNEP1-207ENST00000572043 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLEKHG5O94827 1062 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADGRB2O60241 1585 aa25.6■■□□□ 1.69
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.59■■□□□ 1.69
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSME1Q06323 249 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-207ENST00000572043 NGLY1Q96IV0 654 aa25.58■■□□□ 1.69
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIF1AQ12756 1690 aa25.58■■□□□ 1.68
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CTDNEP1-207ENST00000572043 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP32Q8NFA0 1604 aa25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1-207ENST00000572043 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.55■■□□□ 1.68
CTDNEP1-207ENST00000572043 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.54■■□□□ 1.68
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.54■■□□□ 1.68
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDK19Q9BWU1 502 aa25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CTDNEP1-207ENST00000572043 RXRBP28702 533 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP21Q9UK80 565 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 SBNO1A3KN83 1393 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 TONSLQ96HA7 1378 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP7BP35670 1465 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-207ENST00000572043 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-207ENST00000572043 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-207ENST00000572043 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-207ENST00000572043 CABP2Q9NPB3 220 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGEF10O15013 1369 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-207ENST00000572043 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1-207ENST00000572043 ACEP12821 1306 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1-207ENST00000572043 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1-207ENST00000572043 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-207ENST00000572043 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGS12O14924 1447 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATRNO75882 1429 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-207ENST00000572043 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 EVC2Q86UK5 1308 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1-207ENST00000572043 ITSN1Q15811 1721 aa25.32■■□□□ 1.64
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