RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570016.5

CDIPT-210, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDIPT, Length 1,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-210ENST00000570016 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa31.68■■■□□ 2.66
CDIPT-210ENST00000570016 DLC1Q96QB1 1528 aa31.67■■■□□ 2.66
CDIPT-210ENST00000570016 SHPRHQ149N8 1683 aa31.67■■■□□ 2.66
CDIPT-210ENST00000570016 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
CDIPT-210ENST00000570016 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa31.65■■■□□ 2.66
CDIPT-210ENST00000570016 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa31.64■■■□□ 2.66
CDIPT-210ENST00000570016 ORAI2Q96SN7 254 aa31.62■■■□□ 2.65
CDIPT-210ENST00000570016 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
CDIPT-210ENST00000570016 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
CDIPT-210ENST00000570016 FMN2Q9NZ56 1722 aa31.57■■■□□ 2.64
CDIPT-210ENST00000570016 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
CDIPT-210ENST00000570016 SOCS7O14512 581 aa31.56■■■□□ 2.64
CDIPT-210ENST00000570016 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
CDIPT-210ENST00000570016 LRP6O75581 1613 aa31.56■■■□□ 2.64
CDIPT-210ENST00000570016 PRAM1Q96QH2 718 aa31.54■■■□□ 2.64
CDIPT-210ENST00000570016 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa31.52■■■□□ 2.64
CDIPT-210ENST00000570016 ADGRB2O60241 1585 aa31.51■■■□□ 2.63
CDIPT-210ENST00000570016 PNPLA6Q8IY17 1366 aa31.51■■■□□ 2.63
CDIPT-210ENST00000570016 ESCO1Q5FWF5 840 aa31.5■■■□□ 2.63
CDIPT-210ENST00000570016 TRAK1Q9UPV9 953 aa31.49■■■□□ 2.63
CDIPT-210ENST00000570016 NPHP3Q7Z494 1330 aa31.48■■■□□ 2.63
CDIPT-210ENST00000570016 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CDIPT-210ENST00000570016 POGKQ9P215 609 aa31.47■■■□□ 2.63
CDIPT-210ENST00000570016 PXDNQ92626 1479 aa31.46■■■□□ 2.63
CDIPT-210ENST00000570016 KIF1AQ12756 1690 aa31.44■■■□□ 2.62
CDIPT-210ENST00000570016 NUTM2FA1L443 756 aa31.44■■■□□ 2.62
CDIPT-210ENST00000570016 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
CDIPT-210ENST00000570016 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
CDIPT-210ENST00000570016 POTEAQ6S8J7 498 aa31.42■■■□□ 2.62
CDIPT-210ENST00000570016 ANKARQ7Z5J8 1434 aa31.42■■■□□ 2.62
CDIPT-210ENST00000570016 FOXO3O43524 673 aa31.41■■■□□ 2.62
CDIPT-210ENST00000570016 L3MBTL2Q969R5 705 aa31.4■■■□□ 2.62
CDIPT-210ENST00000570016 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.4■■■□□ 2.62
CDIPT-210ENST00000570016 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
CDIPT-210ENST00000570016 USP32Q8NFA0 1604 aa31.38■■■□□ 2.61
CDIPT-210ENST00000570016 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
CDIPT-210ENST00000570016 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
CDIPT-210ENST00000570016 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CDIPT-210ENST00000570016 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CDIPT-210ENST00000570016 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
CDIPT-210ENST00000570016 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
CDIPT-210ENST00000570016 NBPF1Q3BBV0 1214 aa31.34■■■□□ 2.61
CDIPT-210ENST00000570016 PHF8Q9UPP1 1060 aa31.34■■■□□ 2.61
CDIPT-210ENST00000570016 TULP4Q9NRJ4 1543 aa31.33■■■□□ 2.61
CDIPT-210ENST00000570016 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
CDIPT-210ENST00000570016 WASLO00401 505 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
CDIPT-210ENST00000570016 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
CDIPT-210ENST00000570016 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
CDIPT-210ENST00000570016 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
CDIPT-210ENST00000570016 NEUROD1Q13562 356 aa31.28■■■□□ 2.6
CDIPT-210ENST00000570016 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa31.28■■■□□ 2.6
CDIPT-210ENST00000570016 PRR36Q9H6K5 1346 aa31.27■■■□□ 2.6
CDIPT-210ENST00000570016 KRT28Q7Z3Y7 464 aa31.26■■■□□ 2.6
CDIPT-210ENST00000570016 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa31.26■■■□□ 2.59
CDIPT-210ENST00000570016 SBNO1A3KN83 1393 aa31.24■■■□□ 2.59
CDIPT-210ENST00000570016 AFF2P51816 1311 aa31.23■■■□□ 2.59
CDIPT-210ENST00000570016 PSME1Q06323 249 aa31.23■■■□□ 2.59
CDIPT-210ENST00000570016 ATP7BP35670 1465 aa31.22■■■□□ 2.59
CDIPT-210ENST00000570016 TNS3Q68CZ2 1445 aa31.21■■■□□ 2.59
CDIPT-210ENST00000570016 C8orf37Q96NL8 207 aa31.21■■■□□ 2.59
CDIPT-210ENST00000570016 ADAMTS2O95450 1211 aa31.19■■■□□ 2.58
CDIPT-210ENST00000570016 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa31.19■■■□□ 2.58
CDIPT-210ENST00000570016 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
CDIPT-210ENST00000570016 ITSN1Q15811 1721 aa31.17■■■□□ 2.58
CDIPT-210ENST00000570016 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
CDIPT-210ENST00000570016 CDK19Q9BWU1 502 aa31.16■■■□□ 2.58
CDIPT-210ENST00000570016 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
CDIPT-210ENST00000570016 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
CDIPT-210ENST00000570016 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
CDIPT-210ENST00000570016 GPRASP1Q5JY77 1395 aa31.14■■■□□ 2.58
CDIPT-210ENST00000570016 NGLY1Q96IV0 654 aa31.14■■■□□ 2.58
CDIPT-210ENST00000570016 ARHGEF10O15013 1369 aa31.13■■■□□ 2.57
CDIPT-210ENST00000570016 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CDIPT-210ENST00000570016 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa31.12■■■□□ 2.57
CDIPT-210ENST00000570016 NBPF8Q3BBV2 869 aa31.12■■■□□ 2.57
CDIPT-210ENST00000570016 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
CDIPT-210ENST00000570016 RXRBP28702 533 aa31.11■■■□□ 2.57
CDIPT-210ENST00000570016 QRICH2Q9H0J4 1663 aa31.1■■■□□ 2.57
CDIPT-210ENST00000570016 ALS2Q96Q42 1657 aa31.09■■■□□ 2.57
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC61Q9Y6R9 512 aa31.09■■■□□ 2.57
CDIPT-210ENST00000570016 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
CDIPT-210ENST00000570016 TONSLQ96HA7 1378 aa31.08■■■□□ 2.57
CDIPT-210ENST00000570016 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
CDIPT-210ENST00000570016 PLEKHG3A1L390 1219 aa31.06■■■□□ 2.56
CDIPT-210ENST00000570016 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CDIPT-210ENST00000570016 USP21Q9UK80 565 aa31.05■■■□□ 2.56
CDIPT-210ENST00000570016 ABCA3Q99758 1704 aa31.05■■■□□ 2.56
CDIPT-210ENST00000570016 BCL9LQ86UU0 1499 aa31.04■■■□□ 2.56
CDIPT-210ENST00000570016 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CDIPT-210ENST00000570016 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.03■■■□□ 2.56
CDIPT-210ENST00000570016 SLIT2O94813 1529 aa31.02■■■□□ 2.56
CDIPT-210ENST00000570016 ATRNO75882 1429 aa31.02■■■□□ 2.56
CDIPT-210ENST00000570016 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.56
CDIPT-210ENST00000570016 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CDIPT-210ENST00000570016 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.99■■■□□ 2.55
CDIPT-210ENST00000570016 LMOD2Q6P5Q4 547 aa30.98■■■□□ 2.55
CDIPT-210ENST00000570016 ACEP12821 1306 aa30.98■■■□□ 2.55
CDIPT-210ENST00000570016 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CDIPT-210ENST00000570016 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.96■■■□□ 2.55
CDIPT-210ENST00000570016 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms