RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 STAC3Q96MF2 364 aa24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 IFT172Q9UG01 1749 aa24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 MYOM2P54296 1465 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.34■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 RXRBP28702 533 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 LAMC1P11047 1609 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 C8orf37Q96NL8 207 aa24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 AFF2P51816 1311 aa24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.3■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 NGLY1Q96IV0 654 aa24.28■■□□□ 1.48
SPNS1-211ENST00000568829 FOXO3O43524 673 aa24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 POGKQ9P215 609 aa24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 ADAMTS2O95450 1211 aa24.25■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 NUTM2FA1L443 756 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 PRAM1Q96QH2 718 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 PSME1Q06323 249 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-211ENST00000568829 DLC1Q96QB1 1528 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 USP21Q9UK80 565 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 PXDNQ92626 1479 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 KIF1AQ12756 1690 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-211ENST00000568829 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SPNS1-211ENST00000568829 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-211ENST00000568829 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-211ENST00000568829 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRB1O14514 1584 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-211ENST00000568829 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.451e-9■■■■□ 21.7
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGEF10O15013 1369 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 SBNO1A3KN83 1393 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRB2O60241 1585 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 RGS12O14924 1447 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-211ENST00000568829 ATRNO75882 1429 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 UNC5CLQ8IV45 518 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 ATAD2Q6PL18 1390 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.97■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-211ENST00000568829 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 USP32Q8NFA0 1604 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 SLIT2O94813 1529 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHG5O94827 1062 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC125Q86Z20 511 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 CDK19Q9BWU1 502 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.89■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 VPS72Q15906 364 aa23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 ITSN1Q15811 1721 aa23.86■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.85■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 ATP7BP35670 1465 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.84■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
SPNS1-211ENST00000568829 FAM83GA6ND36 823 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.82■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 BTG4Q9NY30 223 aa23.8■■□□□ 1.4
SPNS1-211ENST00000568829 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
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