RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568721.1

KCTD13-208, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 13, human

TSL 2

Gene KCTD13, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCTD13-208	ENST00000568721	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
KCTD13-208	ENST00000568721	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.97	■■■□□ 2.71
KCTD13-208	ENST00000568721	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
KCTD13-208	ENST00000568721	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.94	■■■□□ 2.7
KCTD13-208	ENST00000568721	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		31.93	■■■□□ 2.7
KCTD13-208	ENST00000568721	PRAM1	Q96QH2	718 aa		31.92	■■■□□ 2.7
KCTD13-208	ENST00000568721	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.91	■■■□□ 2.7
KCTD13-208	ENST00000568721	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
KCTD13-208	ENST00000568721	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		31.91	■■■□□ 2.7
KCTD13-208	ENST00000568721	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		31.9	■■■□□ 2.7
KCTD13-208	ENST00000568721	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.88	■■■□□ 2.69
KCTD13-208	ENST00000568721	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
KCTD13-208	ENST00000568721	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
KCTD13-208	ENST00000568721	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	31.86	■■■□□ 2.69
KCTD13-208	ENST00000568721	POGK	Q9P215	609 aa		31.84	■■■□□ 2.69
KCTD13-208	ENST00000568721	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		31.84	■■■□□ 2.69
KCTD13-208	ENST00000568721	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
KCTD13-208	ENST00000568721	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.82	■■■□□ 2.69
KCTD13-208	ENST00000568721	ADGRB2	O60241	1585 aa		31.82	■■■□□ 2.68
KCTD13-208	ENST00000568721	JCAD	Q9P266	1359 aa		31.8	■■■□□ 2.68
KCTD13-208	ENST00000568721	NUTM2F	A1L443	756 aa		31.79	■■■□□ 2.68
KCTD13-208	ENST00000568721	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.78	■■■□□ 2.68
KCTD13-208	ENST00000568721	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.78	■■■□□ 2.68
KCTD13-208	ENST00000568721	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.76	■■■□□ 2.67
KCTD13-208	ENST00000568721	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		31.76	■■■□□ 2.67
KCTD13-208	ENST00000568721	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
KCTD13-208	ENST00000568721	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
KCTD13-208	ENST00000568721	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
KCTD13-208	ENST00000568721	TONSL	Q96HA7	1378 aa		31.7	■■■□□ 2.67
KCTD13-208	ENST00000568721	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
KCTD13-208	ENST00000568721	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.69	■■■□□ 2.66
KCTD13-208	ENST00000568721	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
KCTD13-208	ENST00000568721	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.66	■■■□□ 2.66
KCTD13-208	ENST00000568721	PXDN	Q92626	1479 aa		31.66	■■■□□ 2.66
KCTD13-208	ENST00000568721	FOXO3	O43524	673 aa		31.66	■■■□□ 2.66
KCTD13-208	ENST00000568721	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.65	■■■□□ 2.66
KCTD13-208	ENST00000568721	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.64	■■■□□ 2.66
KCTD13-208	ENST00000568721	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		31.64	■■■□□ 2.66
KCTD13-208	ENST00000568721	LRP6	O75581	1613 aa		31.64	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.63	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.63	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.62	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.62	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.62	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	ILDR2	Q71H61	639 aa		31.61	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		31.6	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
KCTD13-208	ENST00000568721	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
KCTD13-208	ENST00000568721	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.57	■■■□□ 2.64
KCTD13-208	ENST00000568721	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.57	■■■□□ 2.64
KCTD13-208	ENST00000568721	ATP7B	P35670	1465 aa		31.55	■■■□□ 2.64
KCTD13-208	ENST00000568721	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
KCTD13-208	ENST00000568721	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.55	■■■□□ 2.64
KCTD13-208	ENST00000568721	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.54	■■■□□ 2.64
KCTD13-208	ENST00000568721	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
KCTD13-208	ENST00000568721	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.53	■■■□□ 2.64
KCTD13-208	ENST00000568721	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
KCTD13-208	ENST00000568721	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		31.51	■■■□□ 2.64
KCTD13-208	ENST00000568721	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
KCTD13-208	ENST00000568721	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
KCTD13-208	ENST00000568721	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
KCTD13-208	ENST00000568721	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.49	■■■□□ 2.63
KCTD13-208	ENST00000568721	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.48	■■■□□ 2.63
KCTD13-208	ENST00000568721	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
KCTD13-208	ENST00000568721	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.46	■■■□□ 2.63
KCTD13-208	ENST00000568721	PSME1	Q06323	249 aa		31.44	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.43	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.43	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.42	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.41	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	POTEA	Q6S8J7	498 aa		31.4	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	ALS2	Q96Q42	1657 aa		31.4	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.39	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
KCTD13-208	ENST00000568721	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
KCTD13-208	ENST00000568721	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
KCTD13-208	ENST00000568721	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.37	■■■□□ 2.61
KCTD13-208	ENST00000568721	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.36	■■■□□ 2.61
KCTD13-208	ENST00000568721	ACE	P12821	1306 aa		31.34	■■■□□ 2.61
KCTD13-208	ENST00000568721	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.34	■■■□□ 2.61
KCTD13-208	ENST00000568721	ABCA3	Q99758	1704 aa		31.33	■■■□□ 2.61
KCTD13-208	ENST00000568721	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.32	■■■□□ 2.61
KCTD13-208	ENST00000568721	C8orf37	Q96NL8	207 aa		31.3	■■■□□ 2.6
KCTD13-208	ENST00000568721	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.3	■■■□□ 2.6
KCTD13-208	ENST00000568721	AFF2	P51816	1311 aa		31.29	■■■□□ 2.6
KCTD13-208	ENST00000568721	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		31.28	■■■□□ 2.6
KCTD13-208	ENST00000568721	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.28	■■■□□ 2.6
KCTD13-208	ENST00000568721	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		31.27	■■■□□ 2.6
KCTD13-208	ENST00000568721	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
KCTD13-208	ENST00000568721	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.27	■■■□□ 2.6
KCTD13-208	ENST00000568721	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.26	■■■□□ 2.59
KCTD13-208	ENST00000568721	TESK2	Q96S53	571 aa		31.26	■■■□□ 2.59
KCTD13-208	ENST00000568721	NGLY1	Q96IV0	654 aa		31.25	■■■□□ 2.59
KCTD13-208	ENST00000568721	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59

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