RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6-211ENST00000568316 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.26■■■■□ 3.24
RBBP6-211ENST00000568316 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
RBBP6-211ENST00000568316 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.22■■■■□ 3.23
RBBP6-211ENST00000568316 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
RBBP6-211ENST00000568316 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
RBBP6-211ENST00000568316 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
RBBP6-211ENST00000568316 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.15■■■■□ 3.22
RBBP6-211ENST00000568316 ATF3P18847 181 aa35.14■■■■□ 3.22
RBBP6-211ENST00000568316 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
RBBP6-211ENST00000568316 DCCP43146 1447 aa35.13■■■■□ 3.21
RBBP6-211ENST00000568316 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.12■■■■□ 3.21
RBBP6-211ENST00000568316 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.11■■■■□ 3.21
RBBP6-211ENST00000568316 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.11■■■■□ 3.21
RBBP6-211ENST00000568316 USP47Q96K76 1375 aa35.11■■■■□ 3.21
RBBP6-211ENST00000568316 TOM1O60784 492 aa35.1■■■■□ 3.21
RBBP6-211ENST00000568316 ADGRB2O60241 1585 aa35.08■■■■□ 3.21
RBBP6-211ENST00000568316 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.03■■■■□ 3.2
RBBP6-211ENST00000568316 PIP4K2BP78356 416 aa35.03■■■■□ 3.2
RBBP6-211ENST00000568316 NUTM2FA1L443 756 aa35.02■■■■□ 3.2
RBBP6-211ENST00000568316 MST1RQ04912 1400 aa35.02■■■■□ 3.2
RBBP6-211ENST00000568316 SLAIN2Q9P270 581 aa35.02■■■■□ 3.2
RBBP6-211ENST00000568316 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
RBBP6-211ENST00000568316 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.01■■■■□ 3.19
RBBP6-211ENST00000568316 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
RBBP6-211ENST00000568316 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
RBBP6-211ENST00000568316 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.96■■■■□ 3.19
RBBP6-211ENST00000568316 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP34.95■■■■□ 3.19
RBBP6-211ENST00000568316 CDK19Q9BWU1 502 aa34.95■■■■□ 3.19
RBBP6-211ENST00000568316 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.95■■■■□ 3.19
RBBP6-211ENST00000568316 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.95■■■■□ 3.19
RBBP6-211ENST00000568316 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
RBBP6-211ENST00000568316 TESK2Q96S53 571 aa34.92■■■■□ 3.18
RBBP6-211ENST00000568316 EVC2Q86UK5 1308 aa34.91■■■■□ 3.18
RBBP6-211ENST00000568316 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
RBBP6-211ENST00000568316 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.89■■■■□ 3.18
RBBP6-211ENST00000568316 USP32Q8NFA0 1604 aa34.88■■■■□ 3.17
RBBP6-211ENST00000568316 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.88■■■■□ 3.17
RBBP6-211ENST00000568316 ORAI2Q96SN7 254 aa34.88■■■■□ 3.17
RBBP6-211ENST00000568316 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.88■■■■□ 3.17
RBBP6-211ENST00000568316 BRINP3Q76B58 766 aa34.87■■■■□ 3.17
RBBP6-211ENST00000568316 CABP2Q9NPB3 220 aa34.87■■■■□ 3.17
RBBP6-211ENST00000568316 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.86■■■■□ 3.17
RBBP6-211ENST00000568316 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
RBBP6-211ENST00000568316 ATP7BP35670 1465 aa34.84■■■■□ 3.17
RBBP6-211ENST00000568316 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
RBBP6-211ENST00000568316 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.8■■■■□ 3.16
RBBP6-211ENST00000568316 TMF1P82094 1093 aa34.79■■■■□ 3.16
RBBP6-211ENST00000568316 SLC24A1O60721 1099 aa34.77■■■■□ 3.16
RBBP6-211ENST00000568316 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.76■■■■□ 3.16
RBBP6-211ENST00000568316 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.75■■■■□ 3.15
RBBP6-211ENST00000568316 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.75■■■■□ 3.15
RBBP6-211ENST00000568316 ITSN1Q15811 1721 aa34.75■■■■□ 3.15
RBBP6-211ENST00000568316 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.74■■■■□ 3.15
RBBP6-211ENST00000568316 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
RBBP6-211ENST00000568316 KIF1AQ12756 1690 aa34.73■■■■□ 3.15
RBBP6-211ENST00000568316 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.72■■■■□ 3.15
RBBP6-211ENST00000568316 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.71■■■■□ 3.15
RBBP6-211ENST00000568316 FOXO3O43524 673 aa34.7■■■■□ 3.15
RBBP6-211ENST00000568316 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.69■■■■□ 3.14
RBBP6-211ENST00000568316 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
RBBP6-211ENST00000568316 HSPA1LP34931 641 aa34.68■■■■□ 3.14
RBBP6-211ENST00000568316 ILDR2Q71H61 639 aa34.68■■■■□ 3.14
RBBP6-211ENST00000568316 CABP1Q9NZU7 370 aa34.67■■■■□ 3.14
RBBP6-211ENST00000568316 PHLPP1O60346 1717 aa34.66■■■■□ 3.14
RBBP6-211ENST00000568316 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.65■■■■□ 3.14
RBBP6-211ENST00000568316 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
RBBP6-211ENST00000568316 CDCA8Q53HL2 280 aa34.65■■■■□ 3.14
RBBP6-211ENST00000568316 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
RBBP6-211ENST00000568316 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
RBBP6-211ENST00000568316 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.63■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 TMC1Q8TDI8 760 aa34.63■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.62■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 ACEP12821 1306 aa34.61■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 SOCS7O14512 581 aa34.6■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 PSME1Q06323 249 aa34.59■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 PXDNQ92626 1479 aa34.58■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa34.58■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.13
RBBP6-211ENST00000568316 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.57■■■■□ 3.12
RBBP6-211ENST00000568316 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.52■■■■□ 3.12
RBBP6-211ENST00000568316 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.51■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.49■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 MYOM1P52179 1685 aa34.49■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 AKAP12Q02952 1782 aa34.47■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 USP6P35125 1406 aa34.47■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.45■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 A0A1W2PP64 1363 aa34.45■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 SBNO1A3KN83 1393 aa34.45■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
RBBP6-211ENST00000568316 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
RBBP6-211ENST00000568316 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.44■■■■□ 3.1
RBBP6-211ENST00000568316 WASHC2AQ641Q2 1341 aa34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms