RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567264.1

UBFD1-208, Transcript of ubiquitin family domain containing 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene UBFD1, Length 642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBFD1-208	ENST00000567264	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.98	■■■□□ 2.71
UBFD1-208	ENST00000567264	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.98	■■■□□ 2.71
UBFD1-208	ENST00000567264	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.97	■■■□□ 2.71
UBFD1-208	ENST00000567264	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
UBFD1-208	ENST00000567264	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.96	■■■□□ 2.71
UBFD1-208	ENST00000567264	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.96	■■■□□ 2.71
UBFD1-208	ENST00000567264	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
UBFD1-208	ENST00000567264	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		31.95	■■■□□ 2.7
UBFD1-208	ENST00000567264	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.94	■■■□□ 2.7
UBFD1-208	ENST00000567264	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
UBFD1-208	ENST00000567264	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
UBFD1-208	ENST00000567264	ATF3	P18847	181 aa		31.9	■■■□□ 2.7
UBFD1-208	ENST00000567264	DCC	P43146	1447 aa		31.9	■■■□□ 2.7
UBFD1-208	ENST00000567264	ADGRB2	O60241	1585 aa		31.9	■■■□□ 2.7
UBFD1-208	ENST00000567264	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.89	■■■□□ 2.7
UBFD1-208	ENST00000567264	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.88	■■■□□ 2.69
UBFD1-208	ENST00000567264	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		31.87	■■■□□ 2.69
UBFD1-208	ENST00000567264	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.85	■■■□□ 2.69
UBFD1-208	ENST00000567264	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
UBFD1-208	ENST00000567264	TESK2	Q96S53	571 aa		31.83	■■■□□ 2.69
UBFD1-208	ENST00000567264	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.82	■■■□□ 2.68
UBFD1-208	ENST00000567264	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.79	■■■□□ 2.68
UBFD1-208	ENST00000567264	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.79	■■■□□ 2.68
UBFD1-208	ENST00000567264	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		31.78	■■■□□ 2.68
UBFD1-208	ENST00000567264	TOM1	O60784	492 aa		31.78	■■■□□ 2.68
UBFD1-208	ENST00000567264	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
UBFD1-208	ENST00000567264	TMF1	P82094	1093 aa		31.77	■■■□□ 2.68
UBFD1-208	ENST00000567264	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.76	■■■□□ 2.67
UBFD1-208	ENST00000567264	NUTM2F	A1L443	756 aa		31.75	■■■□□ 2.67
UBFD1-208	ENST00000567264	MST1R	Q04912	1400 aa		31.75	■■■□□ 2.67
UBFD1-208	ENST00000567264	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.73	■■■□□ 2.67
UBFD1-208	ENST00000567264	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.72	■■■□□ 2.67
UBFD1-208	ENST00000567264	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.72	■■■□□ 2.67
UBFD1-208	ENST00000567264	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.71	■■■□□ 2.67
UBFD1-208	ENST00000567264	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.69	■■■□□ 2.66
UBFD1-208	ENST00000567264	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.69	■■■□□ 2.66
UBFD1-208	ENST00000567264	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
UBFD1-208	ENST00000567264	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.67	■■■□□ 2.66
UBFD1-208	ENST00000567264	ATP7B	P35670	1465 aa		31.66	■■■□□ 2.66
UBFD1-208	ENST00000567264	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.66	■■■□□ 2.66
UBFD1-208	ENST00000567264	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
UBFD1-208	ENST00000567264	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.65	■■■□□ 2.66
UBFD1-208	ENST00000567264	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.64	■■■□□ 2.66
UBFD1-208	ENST00000567264	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		31.64	■■■□□ 2.66
UBFD1-208	ENST00000567264	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
UBFD1-208	ENST00000567264	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.63	■■■□□ 2.65
UBFD1-208	ENST00000567264	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
UBFD1-208	ENST00000567264	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.61	■■■□□ 2.65
UBFD1-208	ENST00000567264	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.61	■■■□□ 2.65
UBFD1-208	ENST00000567264	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.59	■■■□□ 2.65
UBFD1-208	ENST00000567264	BRINP3	Q76B58	766 aa		31.58	■■■□□ 2.65
UBFD1-208	ENST00000567264	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.58	■■■□□ 2.65
UBFD1-208	ENST00000567264	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.58	■■■□□ 2.65
UBFD1-208	ENST00000567264	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		31.57	■■■□□ 2.65
UBFD1-208	ENST00000567264	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		31.57	■■■□□ 2.64
UBFD1-208	ENST00000567264	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.55	■■■□□ 2.64
UBFD1-208	ENST00000567264	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
UBFD1-208	ENST00000567264	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.55	■■■□□ 2.64
UBFD1-208	ENST00000567264	TMC1	Q8TDI8	760 aa		31.55	■■■□□ 2.64
UBFD1-208	ENST00000567264	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.53	■■■□□ 2.64
UBFD1-208	ENST00000567264	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.52	■■■□□ 2.64
UBFD1-208	ENST00000567264	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		31.51	■■■□□ 2.64
UBFD1-208	ENST00000567264	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
UBFD1-208	ENST00000567264	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		31.51	■■■□□ 2.63
UBFD1-208	ENST00000567264	CCDC7	Q96M83	1385 aa		31.48	■■■□□ 2.63
UBFD1-208	ENST00000567264	FOXO3	O43524	673 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UBFD1-208	ENST00000567264	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UBFD1-208	ENST00000567264	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UBFD1-208	ENST00000567264	ACE	P12821	1306 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UBFD1-208	ENST00000567264	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UBFD1-208	ENST00000567264	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		31.46	■■■□□ 2.63
UBFD1-208	ENST00000567264	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
UBFD1-208	ENST00000567264	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.43	■■■□□ 2.62
UBFD1-208	ENST00000567264	PSME1	Q06323	249 aa		31.43	■■■□□ 2.62
UBFD1-208	ENST00000567264	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		31.43	■■■□□ 2.62
UBFD1-208	ENST00000567264	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
UBFD1-208	ENST00000567264	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
UBFD1-208	ENST00000567264	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
UBFD1-208	ENST00000567264	MYOM1	P52179	1685 aa		31.41	■■■□□ 2.62
UBFD1-208	ENST00000567264	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.39	■■■□□ 2.62
UBFD1-208	ENST00000567264	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
UBFD1-208	ENST00000567264	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		31.37	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264	AKAP12	Q02952	1782 aa		31.36	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264	PHLPP1	O60346	1717 aa		31.36	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		31.36	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264		A0A1W2PP64	1363 aa		31.36	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264	PXDN	Q92626	1479 aa		31.35	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264	USP6	P35125	1406 aa		31.34	■■■□□ 2.61
UBFD1-208	ENST00000567264	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
UBFD1-208	ENST00000567264	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		31.31	■■■□□ 2.6
UBFD1-208	ENST00000567264	HSPA1L	P34931	641 aa		31.3	■■■□□ 2.6
UBFD1-208	ENST00000567264	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.3	■■■□□ 2.6
UBFD1-208	ENST00000567264	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.3	■■■□□ 2.6
UBFD1-208	ENST00000567264	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
UBFD1-208	ENST00000567264	PANK3	Q9H999	370 aa		31.29	■■■□□ 2.6

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