RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.9■■■□□ 2.7
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa31.87■■■□□ 2.69
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRAM1Q96QH2 718 aa31.86■■■□□ 2.69
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRAK1Q9UPV9 953 aa31.86■■■□□ 2.69
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POGKQ9P215 609 aa31.83■■■□□ 2.69
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C1orf167Q5SNV9 1468 aa31.82■■■□□ 2.68
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF1Q3BBV0 1214 aa31.81■■■□□ 2.68
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADGRB2O60241 1585 aa31.81■■■□□ 2.68
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BRINP3Q76B58 766 aa31.79■■■□□ 2.68
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FMN2Q9NZ56 1722 aa31.79■■■□□ 2.68
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHLPP1O60346 1717 aa31.78■■■□□ 2.68
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP31.77■■■□□ 2.68
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF8Q3BBV2 869 aa31.74■■■□□ 2.67
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NHSL1Q5SYE7 1610 aa31.73■■■□□ 2.67
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.71■■■□□ 2.67
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPRASP1Q5JY77 1395 aa31.7■■■□□ 2.67
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa31.67■■■□□ 2.66
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ORAI2Q96SN7 254 aa31.66■■■□□ 2.66
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKARQ7Z5J8 1434 aa31.65■■■□□ 2.66
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF1AQ12756 1690 aa31.64■■■□□ 2.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUTM2FA1L443 756 aa31.63■■■□□ 2.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ESCO1Q5FWF5 840 aa31.63■■■□□ 2.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 QRICH2Q9H0J4 1663 aa31.62■■■□□ 2.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TULP4Q9NRJ4 1543 aa31.62■■■□□ 2.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP32Q8NFA0 1604 aa31.6■■■□□ 2.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WASLO00401 505 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 JCADQ9P266 1359 aa31.59■■■□□ 2.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.57■■■□□ 2.64
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SHPRHQ149N8 1683 aa31.56■■■□□ 2.64
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NPHP3Q7Z494 1330 aa31.55■■■□□ 2.64
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITSN1Q15811 1721 aa31.52■■■□□ 2.64
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP7BP35670 1465 aa31.52■■■□□ 2.64
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHF8Q9UPP1 1060 aa31.51■■■□□ 2.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRR36Q9H6K5 1346 aa31.5■■■□□ 2.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PXDNQ92626 1479 aa31.5■■■□□ 2.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FOXO3O43524 673 aa31.48■■■□□ 2.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDK19Q9BWU1 502 aa31.48■■■□□ 2.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa31.46■■■□□ 2.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa31.46■■■□□ 2.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa31.45■■■□□ 2.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PNPLA6Q8IY17 1366 aa31.43■■■□□ 2.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EVC2Q86UK5 1308 aa31.41■■■□□ 2.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.41■■■□□ 2.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa31.4■■■□□ 2.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC61Q9Y6R9 512 aa31.38■■■□□ 2.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT28Q7Z3Y7 464 aa31.37■■■□□ 2.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRP6O75581 1613 aa31.35■■■□□ 2.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSME1Q06323 249 aa31.35■■■□□ 2.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SBNO1A3KN83 1393 aa31.34■■■□□ 2.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CABP2Q9NPB3 220 aa31.34■■■□□ 2.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNS3Q68CZ2 1445 aa31.33■■■□□ 2.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP47Q96K76 1375 aa31.33■■■□□ 2.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa31.32■■■□□ 2.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa31.31■■■□□ 2.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLEKHG3A1L390 1219 aa31.3■■■□□ 2.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATAD2Q6PL18 1390 aa31.28■■■□□ 2.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.27■■■□□ 2.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC24A1O60721 1099 aa31.26■■■□□ 2.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGEF10O15013 1369 aa31.26■■■□□ 2.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACEP12821 1306 aa31.25■■■□□ 2.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TESK2Q96S53 571 aa31.25■■■□□ 2.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALS2Q96Q42 1657 aa31.24■■■□□ 2.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CABP1Q9NZU7 370 aa31.2■■■□□ 2.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMOD2Q6P5Q4 547 aa31.17■■■□□ 2.58
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCA3Q99758 1704 aa31.16■■■□□ 2.58
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP6P35125 1406 aa31.15■■■□□ 2.58
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AKAP12Q02952 1782 aa31.14■■■□□ 2.58
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADAMTS2O95450 1211 aa31.12■■■□□ 2.57
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMF1P82094 1093 aa31.12■■■□□ 2.57
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
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