RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.85■■□□□ 1.89
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GCSHP2-201ENST00000560971 DLC1Q96QB1 1528 aa26.83■■□□□ 1.89
GCSHP2-201ENST00000560971 PHLPP1O60346 1717 aa26.82■■□□□ 1.88
GCSHP2-201ENST00000560971 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.82■■□□□ 1.88
GCSHP2-201ENST00000560971 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.82■■□□□ 1.88
GCSHP2-201ENST00000560971 ORAI2Q96SN7 254 aa26.81■■□□□ 1.88
GCSHP2-201ENST00000560971 NUTM2FA1L443 756 aa26.79■■□□□ 1.88
GCSHP2-201ENST00000560971 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
GCSHP2-201ENST00000560971 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.78■■□□□ 1.88
GCSHP2-201ENST00000560971 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
GCSHP2-201ENST00000560971 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.77■■□□□ 1.88
GCSHP2-201ENST00000560971 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.74■■□□□ 1.87
GCSHP2-201ENST00000560971 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
GCSHP2-201ENST00000560971 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
GCSHP2-201ENST00000560971 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
GCSHP2-201ENST00000560971 TONSLQ96HA7 1378 aa26.72■■□□□ 1.87
GCSHP2-201ENST00000560971 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.72■■□□□ 1.87
GCSHP2-201ENST00000560971 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.71■■□□□ 1.87
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GCSHP2-201ENST00000560971 JCADQ9P266 1359 aa26.71■■□□□ 1.87
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GCSHP2-201ENST00000560971 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.67■■□□□ 1.86
GCSHP2-201ENST00000560971 ADGRB2O60241 1585 aa26.66■■□□□ 1.86
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GCSHP2-201ENST00000560971 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
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GCSHP2-201ENST00000560971 USP32Q8NFA0 1604 aa26.59■■□□□ 1.85
GCSHP2-201ENST00000560971 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 SHPRHQ149N8 1683 aa26.59■■□□□ 1.85
GCSHP2-201ENST00000560971 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.59■■□□□ 1.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.58■■□□□ 1.85
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GCSHP2-201ENST00000560971 PXDNQ92626 1479 aa26.56■■□□□ 1.84
GCSHP2-201ENST00000560971 CDK19Q9BWU1 502 aa26.56■■□□□ 1.84
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GCSHP2-201ENST00000560971 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.55■■□□□ 1.84
GCSHP2-201ENST00000560971 LRP6O75581 1613 aa26.55■■□□□ 1.84
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GCSHP2-201ENST00000560971 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.54■■□□□ 1.84
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GCSHP2-201ENST00000560971 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.52■■□□□ 1.84
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GCSHP2-201ENST00000560971 ATP7BP35670 1465 aa26.49■■□□□ 1.83
GCSHP2-201ENST00000560971 PSME1Q06323 249 aa26.48■■□□□ 1.83
GCSHP2-201ENST00000560971 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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GCSHP2-201ENST00000560971 CABP2Q9NPB3 220 aa26.45■■□□□ 1.82
GCSHP2-201ENST00000560971 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.44■■□□□ 1.82
GCSHP2-201ENST00000560971 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
GCSHP2-201ENST00000560971 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.43■■□□□ 1.82
GCSHP2-201ENST00000560971 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.42■■□□□ 1.82
GCSHP2-201ENST00000560971 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
GCSHP2-201ENST00000560971 ADAMTS2O95450 1211 aa26.4■■□□□ 1.82
GCSHP2-201ENST00000560971 EVC2Q86UK5 1308 aa26.39■■□□□ 1.82
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GCSHP2-201ENST00000560971 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.38■■□□□ 1.81
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GCSHP2-201ENST00000560971 PLEKHG5O94827 1062 aa26.35■■□□□ 1.81
GCSHP2-201ENST00000560971 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.35■■□□□ 1.81
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GCSHP2-201ENST00000560971 CABP1Q9NZU7 370 aa26.32■■□□□ 1.8
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GCSHP2-201ENST00000560971 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.32■■□□□ 1.8
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGEF10O15013 1369 aa26.31■■□□□ 1.8
GCSHP2-201ENST00000560971 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.3■■□□□ 1.8
GCSHP2-201ENST00000560971 NGLY1Q96IV0 654 aa26.3■■□□□ 1.8
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
GCSHP2-201ENST00000560971 ALS2Q96Q42 1657 aa26.27■■□□□ 1.8
GCSHP2-201ENST00000560971 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
GCSHP2-201ENST00000560971 TESK2Q96S53 571 aa26.26■■□□□ 1.79
GCSHP2-201ENST00000560971 USP47Q96K76 1375 aa26.25■■□□□ 1.79
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