RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.68□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.67□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.67□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 MIER1Q8N108 512 aa14.67□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 TET3O43151 1660 aa14.66□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 KIF15Q9NS87 1388 aa14.66□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 SLAIN2Q9P270 581 aa14.66□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.65□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 IER5LQ5T953 404 aa14.65□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 PROM2Q8N271 834 aa14.65□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.65□□□□□ -0.06
CS-217ENST00000550044 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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CS-217ENST00000550044 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.63□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 SHPRHQ149N8 1683 aa14.62□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 RXRBP28702 533 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 RASEFQ8IZ41 740 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 BCANQ96GW7 911 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 ADGRB3O60242 1522 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
CS-217ENST00000550044 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 IDI1Q13907 227 aa14.58□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 ADGRL2O95490 1459 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 ERBINQ96RT1 1412 aa14.57□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 C14orf37Q86TY3 774 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.55□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 ROCK1Q13464 1354 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 KANK1Q14678 1352 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 RGS12O14924 1447 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 DIP2AQ14689 1571 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.54□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 AFF2P51816 1311 aa14.53□□□□□ -0.08
CS-217ENST00000550044 ST18O60284 1047 aa14.52□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.51□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 NOS1P29475 1434 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 ZFYVE9O95405 1425 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 PLCG2P16885 1265 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 ATF3P18847 181 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.49□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.48□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 BRINP3Q76B58 766 aa14.47□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 C8orf37Q96NL8 207 aa14.47□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-217ENST00000550044 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.46□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 NUP155O75694 1391 aa14.45□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 NAIPQ13075 1403 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 TBX22Q9Y458 520 aa14.43□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.42□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 EP400Q96L91 3159 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 SNPHO15079 494 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 IFNL1Q8IU54 200 aa14.4□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
CS-217ENST00000550044 TRPM2O94759 1503 aa14.4□□□□□ -0.1
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CS-217ENST00000550044 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 NGLY1Q96IV0 654 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 DCCP43146 1447 aa14.39□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 PIK3R4Q99570 1358 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 HFM1A2PYH4 1435 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 MST1RQ04912 1400 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 UNC13BO14795 1591 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 ADAMTS2O95450 1211 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 MMRN1Q13201 1228 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.37□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-217ENST00000550044 PTPRUQ92729 1446 aa14.37□□□□□ -0.11
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