RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 TONSLQ96HA7 1378 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 ATF3P18847 181 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 SLAIN2Q9P270 581 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-213ENST00000548746 NEUROD1Q13562 356 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 C14orf37Q86TY3 774 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 KIF1AQ12756 1690 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 PHLPP1O60346 1717 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 USP32Q8NFA0 1604 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 PIP4K2BP78356 416 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 PRAM1Q96QH2 718 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 STK26Q9P289 416 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 TULP4Q9NRJ4 1543 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 HSPA1LP34931 641 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 NBPF8Q3BBV2 869 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 BRINP3Q76B58 766 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 SHPRHQ149N8 1683 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 ITSN1Q15811 1721 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 ATP7BP35670 1465 aa8.48□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 PXDNQ92626 1479 aa8.47□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CS-213ENST00000548746 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 POGKQ9P215 609 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 JCADQ9P266 1359 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 ORAI2Q96SN7 254 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 ALS2Q96Q42 1657 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 PNPLA6Q8IY17 1366 aa8.42□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 LRP6O75581 1613 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 SBNO1A3KN83 1393 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.41□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 ABCA3Q99758 1704 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 USP47Q96K76 1375 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 CDK19Q9BWU1 502 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.4□□□□□ -1.06
CS-213ENST00000548746 AKAP12Q02952 1782 aa8.4□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 EVC2Q86UK5 1308 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 NUTM2FA1L443 756 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 FOXO3O43524 673 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 TESK2Q96S53 571 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.39□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 SLC24A1O60721 1099 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 ARHGEF10O15013 1369 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 SSH2Q76I76 1423 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 USP54Q70EL1 1684 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 PSME1Q06323 249 aa8.36□□□□□ -1.07
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