RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548524.5

USP15-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, human

TSL 2

Gene USP15, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP15-208	ENST00000548524	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		13.85	□□□□□ -0.19
USP15-208	ENST00000548524	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		13.85	□□□□□ -0.19
USP15-208	ENST00000548524	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
USP15-208	ENST00000548524	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
USP15-208	ENST00000548524	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.84	□□□□□ -0.19
USP15-208	ENST00000548524	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.84	□□□□□ -0.19
USP15-208	ENST00000548524	MYOM2	P54296	1465 aa		13.84	□□□□□ -0.19
USP15-208	ENST00000548524	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
USP15-208	ENST00000548524	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.83	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		13.82	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.82	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	ABCC11	Q96J66	1382 aa		13.82	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	MST1R	Q04912	1400 aa		13.81	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.81	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	IFT172	Q9UG01	1749 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	JCAD	Q9P266	1359 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	TECPR2	O15040	1411 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	FKBP8	Q14318	412 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	SIRT1	Q96EB6	747 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		13.78	□□□□□ -0.2
USP15-208	ENST00000548524	POGK	Q9P215	609 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	NUTM2F	A1L443	756 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21	2e-8	■■■□□ 14.6
USP15-208	ENST00000548524	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	PRAM1	Q96QH2	718 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	ORAI2	Q96SN7	254 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	LAMC1	P11047	1609 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		13.71	□□□□□ -0.21
USP15-208	ENST00000548524	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	ADGRB1	O14514	1584 aa		13.7	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	SOCS7	O14512	581 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	DLC1	Q96QB1	1528 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	FOXO3	O43524	673 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	LRP6	O75581	1613 aa		13.65	□□□□□ -0.22
USP15-208	ENST00000548524	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	POTEA	Q6S8J7	498 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	SHPRH	Q149N8	1683 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		13.63	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	ADAMTS2	O95450	1211 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	PSME1	Q06323	249 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	C8orf37	Q96NL8	207 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	PXDN	Q92626	1479 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	AFF2	P51816	1311 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	NGLY1	Q96IV0	654 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	CDK19	Q9BWU1	502 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	ADGRB2	O60241	1585 aa		13.58	□□□□□ -0.23
USP15-208	ENST00000548524	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP15-208	ENST00000548524	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
USP15-208	ENST00000548524	KIF1A	Q12756	1690 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP15-208	ENST00000548524	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP15-208	ENST00000548524	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP15-208	ENST00000548524	PLEKHG5	O94827	1062 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP15-208	ENST00000548524	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP15-208	ENST00000548524	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
USP15-208	ENST00000548524	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP15-208	ENST00000548524	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24

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