RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546935.5

CSRNP2-202, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene CSRNP2, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-202ENST00000546935 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.55■■■□□ 2.48
CSRNP2-202ENST00000546935 CCDC7Q96M83 1385 aa30.55■■■□□ 2.48
CSRNP2-202ENST00000546935 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.55■■■□□ 2.48
CSRNP2-202ENST00000546935 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.55■■■□□ 2.48
CSRNP2-202ENST00000546935 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CSRNP2-202ENST00000546935 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.55■■■□□ 2.48
CSRNP2-202ENST00000546935 ABCC11Q96J66 1382 aa30.54■■■□□ 2.48
CSRNP2-202ENST00000546935 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.53■■■□□ 2.48
CSRNP2-202ENST00000546935 DCCP43146 1447 aa30.53■■■□□ 2.48
CSRNP2-202ENST00000546935 KIF7Q2M1P5 1343 aa30.51■■■□□ 2.48
CSRNP2-202ENST00000546935 SLC24A1O60721 1099 aa30.51■■■□□ 2.47
CSRNP2-202ENST00000546935 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.51■■■□□ 2.47
CSRNP2-202ENST00000546935 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
CSRNP2-202ENST00000546935 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CSRNP2-202ENST00000546935 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.5■■■□□ 2.47
CSRNP2-202ENST00000546935 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
CSRNP2-202ENST00000546935 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.47■■■□□ 2.47
CSRNP2-202ENST00000546935 SIRT1Q96EB6 747 aa30.47■■■□□ 2.47
CSRNP2-202ENST00000546935 SLAIN2Q9P270 581 aa30.47■■■□□ 2.47
CSRNP2-202ENST00000546935 PTCH1Q13635 1447 aa30.47■■■□□ 2.47
CSRNP2-202ENST00000546935 C14orf37Q86TY3 774 aa30.45■■■□□ 2.47
CSRNP2-202ENST00000546935 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
CSRNP2-202ENST00000546935 TMF1P82094 1093 aa30.44■■■□□ 2.46
CSRNP2-202ENST00000546935 STK26Q9P289 416 aa30.43■■■□□ 2.46
CSRNP2-202ENST00000546935 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
CSRNP2-202ENST00000546935 ATF3P18847 181 aa30.41■■■□□ 2.46
CSRNP2-202ENST00000546935 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.39■■■□□ 2.46
CSRNP2-202ENST00000546935 PRAM1Q96QH2 718 aa30.37■■■□□ 2.45
CSRNP2-202ENST00000546935 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
CSRNP2-202ENST00000546935 CDCA8Q53HL2 280 aa30.36■■■□□ 2.45
CSRNP2-202ENST00000546935 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.36■■■□□ 2.45
CSRNP2-202ENST00000546935 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.33■■■□□ 2.45
CSRNP2-202ENST00000546935 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
CSRNP2-202ENST00000546935 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.32■■■□□ 2.44
CSRNP2-202ENST00000546935 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CSRNP2-202ENST00000546935 POGKQ9P215 609 aa30.32■■■□□ 2.44
CSRNP2-202ENST00000546935 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.32■■■□□ 2.44
CSRNP2-202ENST00000546935 PHLPP1O60346 1717 aa30.3■■■□□ 2.44
CSRNP2-202ENST00000546935 MYOM1P52179 1685 aa30.3■■■□□ 2.44
CSRNP2-202ENST00000546935 ADGRB2O60241 1585 aa30.3■■■□□ 2.44
CSRNP2-202ENST00000546935 MST1RQ04912 1400 aa30.29■■■□□ 2.44
CSRNP2-202ENST00000546935 EVC2Q86UK5 1308 aa30.27■■■□□ 2.44
CSRNP2-202ENST00000546935 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CSRNP2-202ENST00000546935 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.27■■■□□ 2.44
CSRNP2-202ENST00000546935 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.23■■■□□ 2.43
CSRNP2-202ENST00000546935 JCADQ9P266 1359 aa30.23■■■□□ 2.43
CSRNP2-202ENST00000546935 BRINP3Q76B58 766 aa30.22■■■□□ 2.43
CSRNP2-202ENST00000546935 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CSRNP2-202ENST00000546935 ILDR2Q71H61 639 aa30.21■■■□□ 2.43
CSRNP2-202ENST00000546935 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.21■■■□□ 2.43
CSRNP2-202ENST00000546935 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa30.2■■■□□ 2.42
CSRNP2-202ENST00000546935 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.18■■■□□ 2.42
CSRNP2-202ENST00000546935 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
CSRNP2-202ENST00000546935 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.15■■■□□ 2.42
CSRNP2-202ENST00000546935 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.15■■■□□ 2.42
CSRNP2-202ENST00000546935 SHPRHQ149N8 1683 aa30.14■■■□□ 2.42
CSRNP2-202ENST00000546935 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
CSRNP2-202ENST00000546935 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.13■■■□□ 2.41
CSRNP2-202ENST00000546935 CDK19Q9BWU1 502 aa30.12■■■□□ 2.41
CSRNP2-202ENST00000546935 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.12■■■□□ 2.41
CSRNP2-202ENST00000546935 CABP2Q9NPB3 220 aa30.1■■■□□ 2.41
CSRNP2-202ENST00000546935 SOCS7O14512 581 aa30.09■■■□□ 2.41
CSRNP2-202ENST00000546935 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
CSRNP2-202ENST00000546935 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CSRNP2-202ENST00000546935 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.06■■■□□ 2.4
CSRNP2-202ENST00000546935 PANK3Q9H999 370 aa30.05■■■□□ 2.4
CSRNP2-202ENST00000546935 ATP7BP35670 1465 aa30.05■■■□□ 2.4
CSRNP2-202ENST00000546935 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.05■■■□□ 2.4
CSRNP2-202ENST00000546935 USP32Q8NFA0 1604 aa30.03■■■□□ 2.4
CSRNP2-202ENST00000546935 MIER1Q8N108 512 aa30.02■■■□□ 2.4
CSRNP2-202ENST00000546935 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.01■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 ITSN1Q15811 1721 aa29.99■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.99■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.98■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 ANP32CO43423 234 aa29.98■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.96■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 TMC1Q8TDI8 760 aa29.96■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 LRP6O75581 1613 aa29.96■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CSRNP2-202ENST00000546935 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.94■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 ORAI2Q96SN7 254 aa29.94■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.94■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.94■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 AKAP12Q02952 1782 aa29.93■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.93■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.92■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 KIF1AQ12756 1690 aa29.91■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 A0A1W2PP64 1363 aa29.91■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.91■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 CABP1Q9NZU7 370 aa29.9■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.9■■■□□ 2.38
CSRNP2-202ENST00000546935 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.8 ms