RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.86■■□□□ 1.89
TSPAN4-216ENST00000526055 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.85■■□□□ 1.89
TSPAN4-216ENST00000526055 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.84■■□□□ 1.89
TSPAN4-216ENST00000526055 DLC1Q96QB1 1528 aa26.82■■□□□ 1.88
TSPAN4-216ENST00000526055 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TSPAN4-216ENST00000526055 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.82■■□□□ 1.88
TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRB1O14514 1584 aa26.81■■□□□ 1.88
TSPAN4-216ENST00000526055 SHPRHQ149N8 1683 aa26.81■■□□□ 1.88
TSPAN4-216ENST00000526055 ORAI2Q96SN7 254 aa26.79■■□□□ 1.88
TSPAN4-216ENST00000526055 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TSPAN4-216ENST00000526055 PRAM1Q96QH2 718 aa26.75■■□□□ 1.87
TSPAN4-216ENST00000526055 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
TSPAN4-216ENST00000526055 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.74■■□□□ 1.87
TSPAN4-216ENST00000526055 POGKQ9P215 609 aa26.73■■□□□ 1.87
TSPAN4-216ENST00000526055 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.72■■□□□ 1.87
TSPAN4-216ENST00000526055 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
TSPAN4-216ENST00000526055 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.7■■□□□ 1.87
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TSPAN4-216ENST00000526055 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.7■■□□□ 1.86
TSPAN4-216ENST00000526055 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.7■■□□□ 1.86
TSPAN4-216ENST00000526055 LRP6O75581 1613 aa26.69■■□□□ 1.86
TSPAN4-216ENST00000526055 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TSPAN4-216ENST00000526055 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRB2O60241 1585 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPAN4-216ENST00000526055 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
TSPAN4-216ENST00000526055 NUTM2FA1L443 756 aa26.64■■□□□ 1.86
TSPAN4-216ENST00000526055 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.64■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF1AQ12756 1690 aa26.63■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 FOXO3O43524 673 aa26.63■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PXDNQ92626 1479 aa26.62■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 POTEAQ6S8J7 498 aa26.61■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.6■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.59■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.58■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 PSME1Q06323 249 aa26.54■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 NEUROD1Q13562 356 aa26.54■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
TSPAN4-216ENST00000526055 AFF2P51816 1311 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-216ENST00000526055 USP32Q8NFA0 1604 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4-216ENST00000526055 SBNO1A3KN83 1393 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-216ENST00000526055 C8orf37Q96NL8 207 aa26.49■■□□□ 1.83
TSPAN4-216ENST00000526055 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.47■■□□□ 1.83
TSPAN4-216ENST00000526055 ADAMTS2O95450 1211 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPAN4-216ENST00000526055 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPAN4-216ENST00000526055 NGLY1Q96IV0 654 aa26.45■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.44■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.44■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 ARHGEF10O15013 1369 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 RXRBP28702 533 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 CDK19Q9BWU1 502 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 ATP7BP35670 1465 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 ITSN1Q15811 1721 aa26.39■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TONSLQ96HA7 1378 aa26.38■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.38■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 USP21Q9UK80 565 aa26.36■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.33■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.33■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.32■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ATRNO75882 1429 aa26.29■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ALS2Q96Q42 1657 aa26.28■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 EVC2Q86UK5 1308 aa26.28■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.28■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ACEP12821 1306 aa26.27■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.27■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SLIT2O94813 1529 aa26.27■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.26■■□□□ 1.79
TSPAN4-216ENST00000526055 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
TSPAN4-216ENST00000526055 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms