RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.86■■□□□ 1.89
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TSPAN4-216ENST00000526055 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.84■■□□□ 1.89
TSPAN4-216ENST00000526055 DLC1Q96QB1 1528 aa26.82■■□□□ 1.88
TSPAN4-216ENST00000526055 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TSPAN4-216ENST00000526055 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.82■■□□□ 1.88
TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRB1O14514 1584 aa26.81■■□□□ 1.88
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TSPAN4-216ENST00000526055 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
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TSPAN4-216ENST00000526055 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
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TSPAN4-216ENST00000526055 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.7■■□□□ 1.87
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
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TSPAN4-216ENST00000526055 LRP6O75581 1613 aa26.69■■□□□ 1.86
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TSPAN4-216ENST00000526055 ADGRB2O60241 1585 aa26.67■■□□□ 1.86
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TSPAN4-216ENST00000526055 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.64■■□□□ 1.85
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TSPAN4-216ENST00000526055 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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TSPAN4-216ENST00000526055 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.59■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.58■■□□□ 1.85
TSPAN4-216ENST00000526055 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
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TSPAN4-216ENST00000526055 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 PSME1Q06323 249 aa26.54■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 NEUROD1Q13562 356 aa26.54■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
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TSPAN4-216ENST00000526055 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.53■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
TSPAN4-216ENST00000526055 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.52■■□□□ 1.84
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TSPAN4-216ENST00000526055 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.47■■□□□ 1.83
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TSPAN4-216ENST00000526055 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 ARHGEF10O15013 1369 aa26.43■■□□□ 1.82
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TSPAN4-216ENST00000526055 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 CDK19Q9BWU1 502 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 ATP7BP35670 1465 aa26.42■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
TSPAN4-216ENST00000526055 ITSN1Q15811 1721 aa26.39■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TONSLQ96HA7 1378 aa26.38■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.38■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
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TSPAN4-216ENST00000526055 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
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TSPAN4-216ENST00000526055 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
TSPAN4-216ENST00000526055 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.8
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TSPAN4-216ENST00000526055 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.3■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ATRNO75882 1429 aa26.29■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ALS2Q96Q42 1657 aa26.28■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 EVC2Q86UK5 1308 aa26.28■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.28■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ACEP12821 1306 aa26.27■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.27■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SLIT2O94813 1529 aa26.27■■□□□ 1.8
TSPAN4-216ENST00000526055 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.26■■□□□ 1.79
TSPAN4-216ENST00000526055 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
TSPAN4-216ENST00000526055 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.25■■□□□ 1.79
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