RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 PRAM1Q96QH2 718 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRK-218ENST00000525459 C14orf37Q86TY3 774 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRK-218ENST00000525459 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRK-218ENST00000525459 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PTPRK-218ENST00000525459 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRK-218ENST00000525459 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.45■■□□□ 1.83
PTPRK-218ENST00000525459 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.45■■□□□ 1.83
PTPRK-218ENST00000525459 USP47Q96K76 1375 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRK-218ENST00000525459 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.45■■□□□ 1.82
PTPRK-218ENST00000525459 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PTPRK-218ENST00000525459 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRK-218ENST00000525459 SLC24A1O60721 1099 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRK-218ENST00000525459 ITSN1Q15811 1721 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRK-218ENST00000525459 ATF3P18847 181 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRK-218ENST00000525459 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
PTPRK-218ENST00000525459 TOM1O60784 492 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRK-218ENST00000525459 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PTPRK-218ENST00000525459 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRK-218ENST00000525459 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
PTPRK-218ENST00000525459 MST1RQ04912 1400 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRK-218ENST00000525459 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRK-218ENST00000525459 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PTPRK-218ENST00000525459 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRK-218ENST00000525459 USP32Q8NFA0 1604 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRK-218ENST00000525459 KIF1AQ12756 1690 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRK-218ENST00000525459 EVC2Q86UK5 1308 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRK-218ENST00000525459 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRK-218ENST00000525459 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PTPRK-218ENST00000525459 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRK-218ENST00000525459 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
PTPRK-218ENST00000525459 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRK-218ENST00000525459 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRK-218ENST00000525459 ATP7BP35670 1465 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRK-218ENST00000525459 TESK2Q96S53 571 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRK-218ENST00000525459 SLAIN2Q9P270 581 aa26.25■■□□□ 1.79
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PTPRK-218ENST00000525459 CDK19Q9BWU1 502 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRK-218ENST00000525459 TMF1P82094 1093 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRK-218ENST00000525459 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRK-218ENST00000525459 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
PTPRK-218ENST00000525459 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.2■■□□□ 1.79
PTPRK-218ENST00000525459 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PTPRK-218ENST00000525459 CDCA8Q53HL2 280 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRK-218ENST00000525459 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
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PTPRK-218ENST00000525459 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PTPRK-218ENST00000525459 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRK-218ENST00000525459 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.14■■□□□ 1.77
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.14■■□□□ 1.77
PTPRK-218ENST00000525459 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRK-218ENST00000525459 NUTM2FA1L443 756 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRK-218ENST00000525459 BRINP3Q76B58 766 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRK-218ENST00000525459 CABP2Q9NPB3 220 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRK-218ENST00000525459 PHLPP1O60346 1717 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRK-218ENST00000525459 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
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PTPRK-218ENST00000525459 AKAP12Q02952 1782 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRK-218ENST00000525459 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.11■■□□□ 1.77
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PTPRK-218ENST00000525459 ORAI2Q96SN7 254 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRK-218ENST00000525459 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRK-218ENST00000525459 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRK-218ENST00000525459 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PTPRK-218ENST00000525459 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PTPRK-218ENST00000525459 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.05■■□□□ 1.76
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PTPRK-218ENST00000525459 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
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PTPRK-218ENST00000525459 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26■■□□□ 1.75
PTPRK-218ENST00000525459 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRK-218ENST00000525459 CABP1Q9NZU7 370 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRK-218ENST00000525459 ACEP12821 1306 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRK-218ENST00000525459 FOXO3O43524 673 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRK-218ENST00000525459 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PTPRK-218ENST00000525459 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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PTPRK-218ENST00000525459 SHPRHQ149N8 1683 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRK-218ENST00000525459 ALS2Q96Q42 1657 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRK-218ENST00000525459 PSME1Q06323 249 aa25.96■■□□□ 1.75
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PTPRK-218ENST00000525459 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRK-218ENST00000525459 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRK-218ENST00000525459 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRK-218ENST00000525459 USP6P35125 1406 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 SBNO1A3KN83 1393 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC7Q96M83 1385 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 A0A1W2PP64 1363 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRK-218ENST00000525459 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.9■■□□□ 1.74
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