RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517088.1

RNU6-685P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 685, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-685P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-685P-201ENST00000517088 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF516Q92618 1163 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-685P-201ENST00000517088 TLL1O43897 1013 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-685P-201ENST00000517088 HRCP23327 699 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-685P-201ENST00000517088 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-685P-201ENST00000517088 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-685P-201ENST00000517088 TJAP1Q5JTD0 557 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-685P-201ENST00000517088 TSC1Q92574 1164 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-685P-201ENST00000517088 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
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RNU6-685P-201ENST00000517088 Q3C1V9 767 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 LILRB3O75022 631 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZPR1O75312 459 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 MTMR2Q13614 643 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 BRICD5Q6PL45 260 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 IL21Q9HBE4 155 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 THAP11Q96EK4 314 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 SPSB2Q99619 263 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 CFAP99D6REC4 459 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 RFC5P40937 340 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 RETREG3Q86VR2 466 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRR7Q8TB68 274 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 AP1G2O75843 785 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 KCNC4Q03721 635 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-685P-201ENST00000517088 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 ADH1BP00325 375 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 S1PR4O95977 384 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 SNRKQ9NRH2 765 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 USP17L8P0C7I0 530 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 MSS51Q4VC12 460 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.49□□□□□ -1.37
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RNU6-685P-201ENST00000517088 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-685P-201ENST00000517088 CTHP32929 405 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 MMP16P51512 607 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 LYPD8Q6UX82 237 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 RNF223E7ERA6 249 aa6.45□□□□□ -1.38
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RNU6-685P-201ENST00000517088 DESI1Q6ICB0 168 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 MAP10Q9P2G4 905 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 GGCXP38435 758 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 NR6A1Q15406 480 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 BANK1Q8NDB2 785 aa6.44□□□□□ -1.38
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RNU6-685P-201ENST00000517088 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.42□□□□□ -1.38
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RNU6-685P-201ENST00000517088 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 C14orf37Q86TY3 774 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 POM121Q96HA1 1249 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 KCNH2Q12809 1159 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-685P-201ENST00000517088 A0A0G2JS52 829 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 ABL2P42684 1182 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 ANKLE1Q8NAG6 615 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 LINC01559Q495D7 138 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 IFFO2Q5TF58 517 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 APBB1O00213 710 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 RAD21O60216 631 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 BAP1Q92560 729 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 COG6Q9Y2V7 657 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-685P-201ENST00000517088 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.37□□□□□ -1.39
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