RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPN5P54829 565 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-377P-201ENST00000515965 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q3C1V9 767 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-377P-201ENST00000515965 BANK1Q8NDB2 785 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-377P-201ENST00000515965 CABLES1Q8TDN4 633 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-377P-201ENST00000515965 THAP11Q96EK4 314 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-377P-201ENST00000515965 NR1I2O75469 434 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 FLIIQ13045 1269 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTMR2Q13614 643 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 TJAP1Q5JTD0 557 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 HCSTQ9UBK5 93 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 C6orf229H3BNL8 230 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 RETREG3Q86VR2 466 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 CFAP99D6REC4 459 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZPR1O75312 459 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 DESI1Q6ICB0 168 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTRQ99707 1265 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.61□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 SOCS7O14512 581 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 COPS2P61201 443 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTDSPL2Q05D32 466 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 MMRN1Q13201 1228 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 MCM6Q14566 821 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRR7Q8TB68 274 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL21Q9HBE4 155 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNRKQ9NRH2 765 aa5.6□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 AP1G2O75843 785 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF516Q92618 1163 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPSB2Q99619 263 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-377P-201ENST00000515965 MSS51Q4VC12 460 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 LYPD8Q6UX82 237 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 C14orf37Q86TY3 774 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADH1BP00325 375 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP17L8P0C7I0 530 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 MMP16P51512 607 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTMR14Q8NCE2 650 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZMYND15Q9H091 742 aa5.57□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 A6NJR5 290 aa5.56□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 DXOO77932 396 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 JUNDP17535 347 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNC4Q03721 635 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 NKX2-3Q8TAU0 364 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRN4Q8WUT4 740 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 TLL1O43897 1013 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPRNQ16849 979 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM34Q9BYJ4 488 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSC1Q92574 1164 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC6A16Q9GZN6 736 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 EVA1BQ9NVM1 165 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 COG6Q9Y2V7 657 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-377P-201ENST00000515965 APBB1O00213 710 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFFO2Q5TF58 517 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLUAP1Q96AJ1 413 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 POM121Q96HA1 1249 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRDM9Q9NQV7 894 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAD21O60216 631 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR37L1O60883 481 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPS8L1Q8TE68 723 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 S1PR4O95977 384 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNH2Q12809 1159 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 NR6A1Q15406 480 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 NUDT12Q9BQG2 462 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 GDPD2Q9HCC8 539 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAK2O60296 914 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 IRF5Q13568 498 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAP10Q9P2G4 905 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF223E7ERA6 249 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTHP32929 405 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP1R18Q6NYC8 613 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKLE1Q8NAG6 615 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 GGCXP38435 758 aa5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms