RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 ORAI2Q96SN7 254 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 SIRT1Q96EB6 747 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 STAC3Q96MF2 364 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 LRP6O75581 1613 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 ADGRB1O14514 1584 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NUTM2FA1L443 756 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PRAM1Q96QH2 718 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 DLC1Q96QB1 1528 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP4-211ENST00000493436 POTEAQ6S8J7 498 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 POGKQ9P215 609 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.29■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 FOXO3O43524 673 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF1AQ12756 1690 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 PXDNQ92626 1479 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 ADGRB2O60241 1585 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP4-211ENST00000493436 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 C8orf37Q96NL8 207 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 USP32Q8NFA0 1604 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 AFF2P51816 1311 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAMTS2O95450 1211 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 NEUROD1Q13562 356 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP4-211ENST00000493436 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 NGLY1Q96IV0 654 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 PSME1Q06323 249 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 RXRBP28702 533 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4-211ENST00000493436 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 SBNO1A3KN83 1393 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 ITSN1Q15811 1721 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 CDK19Q9BWU1 502 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 USP21Q9UK80 565 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP7BP35670 1465 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-211ENST00000493436 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF10O15013 1369 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHG5O94827 1062 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCA3Q99758 1704 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ALS2Q96Q42 1657 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP4-211ENST00000493436 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 TONSLQ96HA7 1378 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 ATRNO75882 1429 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 RGS12O14924 1447 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 SLIT2O94813 1529 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 ACEP12821 1306 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.9■■□□□ 1.42
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