RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 LAMC1P11047 1609 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDSP1-211ENST00000492545 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDSP1-211ENST00000492545 ORAI2Q96SN7 254 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDSP1-211ENST00000492545 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDSP1-211ENST00000492545 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDSP1-211ENST00000492545 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDSP1-211ENST00000492545 SHPRHQ149N8 1683 aa34.49■■■■□ 3.11
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDSP1-211ENST00000492545 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.46■■■■□ 3.11
CTDSP1-211ENST00000492545 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
CTDSP1-211ENST00000492545 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
CTDSP1-211ENST00000492545 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
CTDSP1-211ENST00000492545 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.42■■■■□ 3.1
CTDSP1-211ENST00000492545 PRAM1Q96QH2 718 aa34.42■■■■□ 3.1
CTDSP1-211ENST00000492545 LRP6O75581 1613 aa34.41■■■■□ 3.1
CTDSP1-211ENST00000492545 DLC1Q96QB1 1528 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDSP1-211ENST00000492545 POTEAQ6S8J7 498 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDSP1-211ENST00000492545 POGKQ9P215 609 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDSP1-211ENST00000492545 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDSP1-211ENST00000492545 ADGRB1O14514 1584 aa34.38■■■■□ 3.09
CTDSP1-211ENST00000492545 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
CTDSP1-211ENST00000492545 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
CTDSP1-211ENST00000492545 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
CTDSP1-211ENST00000492545 NUTM2FA1L443 756 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDSP1-211ENST00000492545 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.34■■■■□ 3.09
CTDSP1-211ENST00000492545 FOXO3O43524 673 aa34.33■■■■□ 3.09
CTDSP1-211ENST00000492545 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.3■■■■□ 3.08
CTDSP1-211ENST00000492545 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.27■■■■□ 3.08
CTDSP1-211ENST00000492545 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDSP1-211ENST00000492545 PXDNQ92626 1479 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDSP1-211ENST00000492545 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.21■■■■□ 3.07
CTDSP1-211ENST00000492545 AFF2P51816 1311 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF1AQ12756 1690 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 C8orf37Q96NL8 207 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 ADGRB2O60241 1585 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 PSME1Q06323 249 aa34.18■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.18■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAMTS2O95450 1211 aa34.17■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 NGLY1Q96IV0 654 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.15■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 RXRBP28702 533 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
CTDSP1-211ENST00000492545 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
CTDSP1-211ENST00000492545 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDSP1-211ENST00000492545 NBPF1Q3BBV0 1214 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDSP1-211ENST00000492545 SBNO1A3KN83 1393 aa34.08■■■■□ 3.05
CTDSP1-211ENST00000492545 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 NEUROD1Q13562 356 aa34.06■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.05■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.05■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 USP32Q8NFA0 1604 aa34.02■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 USP21Q9UK80 565 aa34.02■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGEF10O15013 1369 aa34.01■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.01■■■■□ 3.04
CTDSP1-211ENST00000492545 CDK19Q9BWU1 502 aa33.99■■■■□ 3.03
CTDSP1-211ENST00000492545 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
CTDSP1-211ENST00000492545 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
CTDSP1-211ENST00000492545 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
CTDSP1-211ENST00000492545 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
CTDSP1-211ENST00000492545 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.94■■■■□ 3.02
CTDSP1-211ENST00000492545 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC61Q9Y6R9 512 aa33.93■■■■□ 3.02
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP7BP35670 1465 aa33.9■■■■□ 3.02
CTDSP1-211ENST00000492545 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.88■■■■□ 3.01
CTDSP1-211ENST00000492545 ATRNO75882 1429 aa33.87■■■■□ 3.01
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHG3A1L390 1219 aa33.86■■■■□ 3.01
CTDSP1-211ENST00000492545 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.86■■■■□ 3.01
CTDSP1-211ENST00000492545 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
CTDSP1-211ENST00000492545 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
CTDSP1-211ENST00000492545 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.84■■■■□ 3.01
CTDSP1-211ENST00000492545 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
CTDSP1-211ENST00000492545 ITSN1Q15811 1721 aa33.83■■■■□ 3.01
CTDSP1-211ENST00000492545 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
CTDSP1-211ENST00000492545 SLIT2O94813 1529 aa33.81■■■■□ 3
CTDSP1-211ENST00000492545 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
CTDSP1-211ENST00000492545 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa33.8■■■■□ 3
CTDSP1-211ENST00000492545 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
CTDSP1-211ENST00000492545 TONSLQ96HA7 1378 aa33.8■■■■□ 3
CTDSP1-211ENST00000492545 RGS12O14924 1447 aa33.79■■■■□ 3
CTDSP1-211ENST00000492545 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.79■■■■□ 3
CTDSP1-211ENST00000492545 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
CTDSP1-211ENST00000492545 ACEP12821 1306 aa33.79■■■■□ 3
CTDSP1-211ENST00000492545 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33.77■■■■□ 3
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHG5O94827 1062 aa33.76■■■□□ 2.99
CTDSP1-211ENST00000492545 EVC2Q86UK5 1308 aa33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms