RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.54■■■□□ 2
NISCH-209ENST00000485765 PRAM1Q96QH2 718 aa27.54■■■□□ 2
NISCH-209ENST00000485765 NEUROD1Q13562 356 aa27.53■■■□□ 2
NISCH-209ENST00000485765 ORAI2Q96SN7 254 aa27.52■■■□□ 2
NISCH-209ENST00000485765 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.52■■■□□ 2
NISCH-209ENST00000485765 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
NISCH-209ENST00000485765 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
NISCH-209ENST00000485765 JCADQ9P266 1359 aa27.49■■□□□ 1.99
NISCH-209ENST00000485765 POGKQ9P215 609 aa27.49■■□□□ 1.99
NISCH-209ENST00000485765 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.47■■□□□ 1.99
NISCH-209ENST00000485765 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.46■■□□□ 1.99
NISCH-209ENST00000485765 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.45■■□□□ 1.98
NISCH-209ENST00000485765 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
NISCH-209ENST00000485765 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.45■■□□□ 1.98
NISCH-209ENST00000485765 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.43■■□□□ 1.98
NISCH-209ENST00000485765 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
NISCH-209ENST00000485765 NUTM2FA1L443 756 aa27.41■■□□□ 1.98
NISCH-209ENST00000485765 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
NISCH-209ENST00000485765 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.4■■□□□ 1.98
NISCH-209ENST00000485765 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.39■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 ADGRB2O60241 1585 aa27.37■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 ILDR2Q71H61 639 aa27.37■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.36■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.35■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 SHPRHQ149N8 1683 aa27.34■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 FOXO3O43524 673 aa27.34■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.33■■□□□ 1.97
NISCH-209ENST00000485765 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
NISCH-209ENST00000485765 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
NISCH-209ENST00000485765 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.32■■□□□ 1.96
NISCH-209ENST00000485765 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.3■■□□□ 1.96
NISCH-209ENST00000485765 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.3■■□□□ 1.96
NISCH-209ENST00000485765 TONSLQ96HA7 1378 aa27.29■■□□□ 1.96
NISCH-209ENST00000485765 PXDNQ92626 1479 aa27.29■■□□□ 1.96
NISCH-209ENST00000485765 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.28■■□□□ 1.96
NISCH-209ENST00000485765 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
NISCH-209ENST00000485765 LRP6O75581 1613 aa27.27■■□□□ 1.96
NISCH-209ENST00000485765 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.27■■□□□ 1.96
NISCH-209ENST00000485765 USP32Q8NFA0 1604 aa27.26■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 KIF1AQ12756 1690 aa27.25■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.24■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.24■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.24■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 CDK19Q9BWU1 502 aa27.23■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.22■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
NISCH-209ENST00000485765 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.2■■□□□ 1.94
NISCH-209ENST00000485765 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
NISCH-209ENST00000485765 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.19■■□□□ 1.94
NISCH-209ENST00000485765 PSME1Q06323 249 aa27.19■■□□□ 1.94
NISCH-209ENST00000485765 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
NISCH-209ENST00000485765 POTEAQ6S8J7 498 aa27.16■■□□□ 1.94
NISCH-209ENST00000485765 ATP7BP35670 1465 aa27.16■■□□□ 1.94
NISCH-209ENST00000485765 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
NISCH-209ENST00000485765 SBNO1A3KN83 1393 aa27.15■■□□□ 1.94
NISCH-209ENST00000485765 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.14■■□□□ 1.94
NISCH-209ENST00000485765 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.14■■□□□ 1.94
NISCH-209ENST00000485765 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.13■■□□□ 1.93
NISCH-209ENST00000485765 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.13■■□□□ 1.93
NISCH-209ENST00000485765 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.11■■□□□ 1.93
NISCH-209ENST00000485765 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
NISCH-209ENST00000485765 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
NISCH-209ENST00000485765 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.09■■□□□ 1.93
NISCH-209ENST00000485765 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.09■■□□□ 1.93
NISCH-209ENST00000485765 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
NISCH-209ENST00000485765 SOCS7O14512 581 aa27.07■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 ADAMTS2O95450 1211 aa27.07■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 CABP2Q9NPB3 220 aa27.07■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 EVC2Q86UK5 1308 aa27.07■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 AFF2P51816 1311 aa27.06■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 C8orf37Q96NL8 207 aa27.05■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 ARHGEF10O15013 1369 aa27.05■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 ITSN1Q15811 1721 aa27.04■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 ACEP12821 1306 aa27.04■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.04■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.03■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 NGLY1Q96IV0 654 aa27.03■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
NISCH-209ENST00000485765 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
NISCH-209ENST00000485765 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.99■■□□□ 1.91
NISCH-209ENST00000485765 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.99■■□□□ 1.91
NISCH-209ENST00000485765 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.98■■□□□ 1.91
NISCH-209ENST00000485765 CABP1Q9NZU7 370 aa26.98■■□□□ 1.91
NISCH-209ENST00000485765 ALS2Q96Q42 1657 aa26.97■■□□□ 1.91
NISCH-209ENST00000485765 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
NISCH-209ENST00000485765 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
NISCH-209ENST00000485765 USP21Q9UK80 565 aa26.93■■□□□ 1.9
NISCH-209ENST00000485765 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms