RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473511.5

MIB2-208, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 1,332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-208	ENST00000473511	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		33.21	■■■□□ 2.91
MIB2-208	ENST00000473511	ORAI2	Q96SN7	254 aa		33.21	■■■□□ 2.91
MIB2-208	ENST00000473511	ADGRB1	O14514	1584 aa		33.16	■■■□□ 2.9
MIB2-208	ENST00000473511	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.16	■■■□□ 2.9
MIB2-208	ENST00000473511	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.15	■■■□□ 2.9
MIB2-208	ENST00000473511	NUTM2F	A1L443	756 aa		33.15	■■■□□ 2.9
MIB2-208	ENST00000473511	SIRT1	Q96EB6	747 aa		33.15	■■■□□ 2.9
MIB2-208	ENST00000473511	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	33.14	■■■□□ 2.9
MIB2-208	ENST00000473511	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
MIB2-208	ENST00000473511	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.14	■■■□□ 2.9
MIB2-208	ENST00000473511	PRAM1	Q96QH2	718 aa		33.13	■■■□□ 2.89
MIB2-208	ENST00000473511	SOCS7	O14512	581 aa		33.12	■■■□□ 2.89
MIB2-208	ENST00000473511	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		33.12	■■■□□ 2.89
MIB2-208	ENST00000473511	LRP6	O75581	1613 aa		33.11	■■■□□ 2.89
MIB2-208	ENST00000473511	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
MIB2-208	ENST00000473511	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		33.1	■■■□□ 2.89
MIB2-208	ENST00000473511	POGK	Q9P215	609 aa		33.09	■■■□□ 2.89
MIB2-208	ENST00000473511	DLC1	Q96QB1	1528 aa		33.09	■■■□□ 2.89
MIB2-208	ENST00000473511	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-208	ENST00000473511	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-208	ENST00000473511	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-208	ENST00000473511	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-208	ENST00000473511	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		33.06	■■■□□ 2.88
MIB2-208	ENST00000473511	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
MIB2-208	ENST00000473511	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.03	■■■□□ 2.88
MIB2-208	ENST00000473511	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.02	■■■□□ 2.88
MIB2-208	ENST00000473511	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
MIB2-208	ENST00000473511	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		33	■■■□□ 2.87
MIB2-208	ENST00000473511	FOXO3	O43524	673 aa		33	■■■□□ 2.87
MIB2-208	ENST00000473511	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33	■■■□□ 2.87
MIB2-208	ENST00000473511	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
MIB2-208	ENST00000473511	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
MIB2-208	ENST00000473511	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.97	■■■□□ 2.87
MIB2-208	ENST00000473511	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
MIB2-208	ENST00000473511	PXDN	Q92626	1479 aa		32.95	■■■□□ 2.86
MIB2-208	ENST00000473511	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.94	■■■□□ 2.86
MIB2-208	ENST00000473511	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.93	■■■□□ 2.86
MIB2-208	ENST00000473511	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
MIB2-208	ENST00000473511	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.92	■■■□□ 2.86
MIB2-208	ENST00000473511	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MIB2-208	ENST00000473511	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
MIB2-208	ENST00000473511	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.9	■■■□□ 2.86
MIB2-208	ENST00000473511	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.89	■■■□□ 2.86
MIB2-208	ENST00000473511	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.86	■■■□□ 2.85
MIB2-208	ENST00000473511	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.85	■■■□□ 2.85
MIB2-208	ENST00000473511	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.85	■■■□□ 2.85
MIB2-208	ENST00000473511	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
MIB2-208	ENST00000473511	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.85	■■■□□ 2.85
MIB2-208	ENST00000473511	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
MIB2-208	ENST00000473511	AFF2	P51816	1311 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MIB2-208	ENST00000473511	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.82	■■■□□ 2.84
MIB2-208	ENST00000473511	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MIB2-208	ENST00000473511	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
MIB2-208	ENST00000473511	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
MIB2-208	ENST00000473511	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MIB2-208	ENST00000473511	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MIB2-208	ENST00000473511	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.78	■■■□□ 2.84
MIB2-208	ENST00000473511	PSME1	Q06323	249 aa		32.76	■■■□□ 2.83
MIB2-208	ENST00000473511	NGLY1	Q96IV0	654 aa		32.76	■■■□□ 2.83
MIB2-208	ENST00000473511	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.73	■■■□□ 2.83
MIB2-208	ENST00000473511	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.71	■■■□□ 2.83
MIB2-208	ENST00000473511	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.71	■■■□□ 2.83
MIB2-208	ENST00000473511	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	ATP7B	P35670	1465 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.68	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.68	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	RXRB	P28702	533 aa		32.67	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.66	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.66	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.64	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
MIB2-208	ENST00000473511	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.63	■■■□□ 2.81
MIB2-208	ENST00000473511	USP21	Q9UK80	565 aa		32.63	■■■□□ 2.81
MIB2-208	ENST00000473511	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.62	■■■□□ 2.81
MIB2-208	ENST00000473511	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32.62	■■■□□ 2.81
MIB2-208	ENST00000473511	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.62	■■■□□ 2.81
MIB2-208	ENST00000473511	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
MIB2-208	ENST00000473511	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
MIB2-208	ENST00000473511	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
MIB2-208	ENST00000473511	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
MIB2-208	ENST00000473511	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
MIB2-208	ENST00000473511	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MIB2-208	ENST00000473511	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MIB2-208	ENST00000473511	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-208	ENST00000473511	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-208	ENST00000473511	CABP2	Q9NPB3	220 aa		32.55	■■■□□ 2.8
MIB2-208	ENST00000473511	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
MIB2-208	ENST00000473511	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MIB2-208	ENST00000473511	ABCA3	Q99758	1704 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MIB2-208	ENST00000473511	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
MIB2-208	ENST00000473511	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.51	■■■□□ 2.8
MIB2-208	ENST00000473511	ACE	P12821	1306 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MIB2-208	ENST00000473511	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-208	ENST00000473511	ATRN	O75882	1429 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MIB2-208	ENST00000473511	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MIB2-208	ENST00000473511	RGS12	O14924	1447 aa		32.48	■■■□□ 2.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 236.3 ms