RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473511.5

MIB2-208, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 5

Gene MIB2, Length 1,332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-208ENST00000473511 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.99■■■■■ 6.55
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MIB2-208ENST00000473511 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.21■■■■■ 5.15
MIB2-208ENST00000473511 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.06■■■■■ 5.12
MIB2-208ENST00000473511 NACADO15069 1562 aa47.03■■■■■ 5.12
MIB2-208ENST00000473511 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.57■■■■■ 5.05
MIB2-208ENST00000473511 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
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MIB2-208ENST00000473511 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.13■■■■■ 4.98
MIB2-208ENST00000473511 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.07■■■■■ 4.972e-6■■□□□ 11.7
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MIB2-208ENST00000473511 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.65■■■■■ 4.9
MIB2-208ENST00000473511 SCRIBQ14160 1630 aa45.63■■■■■ 4.89
MIB2-208ENST00000473511 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.22■■■■■ 4.83
MIB2-208ENST00000473511 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
MIB2-208ENST00000473511 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.57■■■■■ 4.73
MIB2-208ENST00000473511 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.36■■■■■ 4.69
MIB2-208ENST00000473511 SMARCA4P51532 1647 aa43.54■■■■■ 4.56
MIB2-208ENST00000473511 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
MIB2-208ENST00000473511 NCAPD3P42695 1498 aa43.41■■■■■ 4.54
MIB2-208ENST00000473511 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.4■■■■■ 4.54
MIB2-208ENST00000473511 SMARCA2P51531 1590 aa43.32■■■■■ 4.53
MIB2-208ENST00000473511 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.18■■■■■ 4.5
MIB2-208ENST00000473511 HMGXB3Q12766 1538 aa43.16■■■■■ 4.5
MIB2-208ENST00000473511 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.07■■■■■ 4.49
MIB2-208ENST00000473511 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.05■■■■■ 4.48
MIB2-208ENST00000473511 WIZO95785 1651 aa42.7■■■■■ 4.43
MIB2-208ENST00000473511 NESP48681 1621 aa42.58■■■■■ 4.41
MIB2-208ENST00000473511 ERCC6Q03468 1493 aa42.56■■■■■ 4.4
MIB2-208ENST00000473511 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
MIB2-208ENST00000473511 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.33■■■■■ 4.37
MIB2-208ENST00000473511 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
MIB2-208ENST00000473511 CUX2O14529 1486 aa42.18■■■■■ 4.34
MIB2-208ENST00000473511 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.15■■■■■ 4.34
MIB2-208ENST00000473511 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.08■■■■■ 4.33
MIB2-208ENST00000473511 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.04■■■■■ 4.32
MIB2-208ENST00000473511 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
MIB2-208ENST00000473511 CFTRP13569 1480 aa41.81■■■■■ 4.28
MIB2-208ENST00000473511 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.71■■■■■ 4.27
MIB2-208ENST00000473511 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.7■■■■■ 4.27
MIB2-208ENST00000473511 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.7■■■■■ 4.27
MIB2-208ENST00000473511 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.67■■■■■ 4.26
MIB2-208ENST00000473511 WDR62O43379 1518 aa41.55■■■■■ 4.24
MIB2-208ENST00000473511 PRDM2Q13029 1718 aa41.42■■■■■ 4.22
MIB2-208ENST00000473511 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.39■■■■■ 4.22
MIB2-208ENST00000473511 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
MIB2-208ENST00000473511 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
MIB2-208ENST00000473511 TOPBP1Q92547 1522 aa40.98■■■■■ 4.15
MIB2-208ENST00000473511 ABCC8Q09428 1581 aa40.89■■■■■ 4.14
MIB2-208ENST00000473511 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.88■■■■■ 4.13
MIB2-208ENST00000473511 IFT140Q96RY7 1462 aa40.81■■■■■ 4.12
MIB2-208ENST00000473511 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
MIB2-208ENST00000473511 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
MIB2-208ENST00000473511 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
MIB2-208ENST00000473511 CUX1P39880 1505 aa40.53■■■■■ 4.08
MIB2-208ENST00000473511 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.5■■■■■ 4.07
MIB2-208ENST00000473511 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.47■■■■■ 4.07
MIB2-208ENST00000473511 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.47■■■■■ 4.07
MIB2-208ENST00000473511 SOGA1O94964 1423 aa40.43■■■■■ 4.06
MIB2-208ENST00000473511 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.42■■■■■ 4.068e-10■■■■□ 24.5
MIB2-208ENST00000473511 OSCARQ8IYS5 282 aa40.4■■■■■ 4.06
MIB2-208ENST00000473511 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
MIB2-208ENST00000473511 WDR97A6NE52 1622 aa40.14■■■■■ 4.02
MIB2-208ENST00000473511 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.12■■■■■ 4.01
MIB2-208ENST00000473511 CHD1O14646 1710 aa40.06■■■■■ 4
MIB2-208ENST00000473511 FBLN2P98095 1184 aa40.06■■■■■ 4
MIB2-208ENST00000473511 SYNJ1O43426 1573 aa40.05■■■■■ 4
MIB2-208ENST00000473511 TOP2BQ02880 1626 aa40.05■■■■■ 4
MIB2-208ENST00000473511 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.03■■■■■ 4
MIB2-208ENST00000473511 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.03■■■■■ 4
MIB2-208ENST00000473511 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.02■■■■■ 4
MIB2-208ENST00000473511 GRIN2BQ13224 1484 aa40■■■■□ 3.99
MIB2-208ENST00000473511 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.96■■■■□ 3.99
MIB2-208ENST00000473511 TRIM41Q8WV44 630 aa39.95■■■■□ 3.99
MIB2-208ENST00000473511 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
MIB2-208ENST00000473511 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.89■■■■□ 3.98
MIB2-208ENST00000473511 PBRM1Q86U86 1689 aa39.89■■■■□ 3.98
MIB2-208ENST00000473511 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
MIB2-208ENST00000473511 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
MIB2-208ENST00000473511 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
MIB2-208ENST00000473511 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
MIB2-208ENST00000473511 SYNJ2O15056 1496 aa39.78■■■■□ 3.96
MIB2-208ENST00000473511 ARHGEF11O15085 1522 aa39.76■■■■□ 3.96
MIB2-208ENST00000473511 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.6■■■■□ 3.93
MIB2-208ENST00000473511 ADAMTS12P58397 1594 aa39.56■■■■□ 3.92
MIB2-208ENST00000473511 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.52■■■■□ 3.92
MIB2-208ENST00000473511 GRIN2AQ12879 1464 aa39.49■■■■□ 3.91
MIB2-208ENST00000473511 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.48■■■■□ 3.91
MIB2-208ENST00000473511 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.44■■■■□ 3.9
MIB2-208ENST00000473511 ARAP1Q96P48 1450 aa39.42■■■■□ 3.9
MIB2-208ENST00000473511 CEP170Q5SW79 1584 aa39.32■■■■□ 3.89
MIB2-208ENST00000473511 NUP160Q12769 1436 aa39.31■■■■□ 3.88
MIB2-208ENST00000473511 KIF27Q86VH2 1401 aa39.3■■■■□ 3.88
MIB2-208ENST00000473511 IGF1RP08069 1367 aa39.19■■■■□ 3.86
MIB2-208ENST00000473511 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.08■■■■□ 3.85
MIB2-208ENST00000473511 CUL7Q14999 1698 aa39.08■■■■□ 3.85
MIB2-208ENST00000473511 SHROOM2Q13796 1616 aa39.05■■■■□ 3.84
MIB2-208ENST00000473511 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.99■■■■□ 3.83
MIB2-208ENST00000473511 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.97■■■■□ 3.83
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