RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.46	■■■■■ 4.39
FBXO18-208	ENST00000470089	SIRT1	Q96EB6	747 aa		42.46	■■■■■ 4.39
FBXO18-208	ENST00000470089	NEUROD1	Q13562	356 aa		42.43	■■■■■ 4.38
FBXO18-208	ENST00000470089	PRAM1	Q96QH2	718 aa		42.43	■■■■■ 4.38
FBXO18-208	ENST00000470089	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FBXO18-208	ENST00000470089	DLC1	Q96QB1	1528 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FBXO18-208	ENST00000470089	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	42.42	■■■■■ 4.38
FBXO18-208	ENST00000470089	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
FBXO18-208	ENST00000470089	ORAI2	Q96SN7	254 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FBXO18-208	ENST00000470089	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		42.42	■■■■■ 4.38
FBXO18-208	ENST00000470089	NUTM2F	A1L443	756 aa		42.39	■■■■■ 4.38
FBXO18-208	ENST00000470089	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.37	■■■■■ 4.37
FBXO18-208	ENST00000470089	POGK	Q9P215	609 aa		42.37	■■■■■ 4.37
FBXO18-208	ENST00000470089	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	42.36	■■■■■ 4.37
FBXO18-208	ENST00000470089	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		42.36	■■■■■ 4.37
FBXO18-208	ENST00000470089	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		42.35	■■■■■ 4.37
FBXO18-208	ENST00000470089	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		42.34	■■■■■ 4.37
FBXO18-208	ENST00000470089	SHPRH	Q149N8	1683 aa		42.31	■■■■■ 4.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		42.31	■■■■■ 4.36
FBXO18-208	ENST00000470089	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
FBXO18-208	ENST00000470089	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		42.25	■■■■■ 4.35
FBXO18-208	ENST00000470089	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
FBXO18-208	ENST00000470089	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
FBXO18-208	ENST00000470089	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
FBXO18-208	ENST00000470089	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	42.21	■■■■■ 4.35
FBXO18-208	ENST00000470089	ADGRB2	O60241	1585 aa		42.21	■■■■■ 4.35
FBXO18-208	ENST00000470089	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.2	■■■■■ 4.35
FBXO18-208	ENST00000470089	LRP6	O75581	1613 aa		42.19	■■■■■ 4.34
FBXO18-208	ENST00000470089	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	42.18	■■■■■ 4.34
FBXO18-208	ENST00000470089	FOXO3	O43524	673 aa		42.15	■■■■■ 4.34
FBXO18-208	ENST00000470089	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		42.14	■■■■■ 4.34
FBXO18-208	ENST00000470089	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.33
FBXO18-208	ENST00000470089	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.33
FBXO18-208	ENST00000470089	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.33
FBXO18-208	ENST00000470089	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.33
FBXO18-208	ENST00000470089	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		42.13	■■■■■ 4.33
FBXO18-208	ENST00000470089	KIF1A	Q12756	1690 aa		42.12	■■■■■ 4.33
FBXO18-208	ENST00000470089	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
FBXO18-208	ENST00000470089	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		42.11	■■■■■ 4.33
FBXO18-208	ENST00000470089	USP32	Q8NFA0	1604 aa		42.11	■■■■■ 4.33
FBXO18-208	ENST00000470089	PXDN	Q92626	1479 aa		42.1	■■■■■ 4.33
FBXO18-208	ENST00000470089	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
FBXO18-208	ENST00000470089	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		42.06	■■■■■ 4.32
FBXO18-208	ENST00000470089	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
FBXO18-208	ENST00000470089	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		42.05	■■■■■ 4.32
FBXO18-208	ENST00000470089	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		42.04	■■■■■ 4.32
FBXO18-208	ENST00000470089	TONSL	Q96HA7	1378 aa		42.03	■■■■■ 4.32
FBXO18-208	ENST00000470089	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		42.01	■■■■■ 4.32
FBXO18-208	ENST00000470089	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		42	■■■■■ 4.31
FBXO18-208	ENST00000470089	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		41.99	■■■■■ 4.31
FBXO18-208	ENST00000470089	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
FBXO18-208	ENST00000470089	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		41.98	■■■■■ 4.31
FBXO18-208	ENST00000470089	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		41.96	■■■■■ 4.31
FBXO18-208	ENST00000470089	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	41.96	■■■■■ 4.31
FBXO18-208	ENST00000470089	POTEA	Q6S8J7	498 aa		41.94	■■■■■ 4.3
FBXO18-208	ENST00000470089	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	41.94	■■■■■ 4.3
FBXO18-208	ENST00000470089	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	41.94	■■■■■ 4.3
FBXO18-208	ENST00000470089	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		41.93	■■■■■ 4.3
FBXO18-208	ENST00000470089	CDK19	Q9BWU1	502 aa		41.91	■■■■■ 4.3
FBXO18-208	ENST00000470089	ATP7B	P35670	1465 aa		41.88	■■■■■ 4.29
FBXO18-208	ENST00000470089	ITSN1	Q15811	1721 aa		41.87	■■■■■ 4.29
FBXO18-208	ENST00000470089	ADAMTS2	O95450	1211 aa		41.87	■■■■■ 4.29
FBXO18-208	ENST00000470089	PSME1	Q06323	249 aa		41.87	■■■■■ 4.29
FBXO18-208	ENST00000470089	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		41.87	■■■■■ 4.29
FBXO18-208	ENST00000470089	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	41.86	■■■■■ 4.29
FBXO18-208	ENST00000470089	SOCS7	O14512	581 aa		41.85	■■■■■ 4.29
FBXO18-208	ENST00000470089	C8orf37	Q96NL8	207 aa		41.84	■■■■■ 4.29
FBXO18-208	ENST00000470089	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		41.81	■■■■■ 4.28
FBXO18-208	ENST00000470089	AFF2	P51816	1311 aa		41.8	■■■■■ 4.28
FBXO18-208	ENST00000470089	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		41.79	■■■■■ 4.28
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	41.78	■■■■■ 4.28
FBXO18-208	ENST00000470089	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	41.78	■■■■■ 4.28
FBXO18-208	ENST00000470089	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		41.77	■■■■■ 4.28
FBXO18-208	ENST00000470089	SBNO1	A3KN83	1393 aa		41.77	■■■■■ 4.28
FBXO18-208	ENST00000470089	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		41.77	■■■■■ 4.28
FBXO18-208	ENST00000470089	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	41.76	■■■■■ 4.28
FBXO18-208	ENST00000470089	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		41.76	■■■■■ 4.28
FBXO18-208	ENST00000470089	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	41.75	■■■■■ 4.27
FBXO18-208	ENST00000470089	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		41.74	■■■■■ 4.27
FBXO18-208	ENST00000470089	PLEKHG5	O94827	1062 aa		41.73	■■■■■ 4.27
FBXO18-208	ENST00000470089	NGLY1	Q96IV0	654 aa		41.73	■■■■■ 4.27
FBXO18-208	ENST00000470089	CABP2	Q9NPB3	220 aa		41.72	■■■■■ 4.27
FBXO18-208	ENST00000470089	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	41.72	■■■■■ 4.27
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		41.7	■■■■■ 4.27
FBXO18-208	ENST00000470089	ARHGEF10	O15013	1369 aa		41.66	■■■■■ 4.26
FBXO18-208	ENST00000470089	ALS2	Q96Q42	1657 aa		41.66	■■■■■ 4.26
FBXO18-208	ENST00000470089	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		41.66	■■■■■ 4.26
FBXO18-208	ENST00000470089	ACE	P12821	1306 aa		41.64	■■■■■ 4.26
FBXO18-208	ENST00000470089	ABCA3	Q99758	1704 aa		41.64	■■■■■ 4.26
FBXO18-208	ENST00000470089	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	41.63	■■■■■ 4.25
FBXO18-208	ENST00000470089	EVC2	Q86UK5	1308 aa		41.63	■■■■■ 4.25
FBXO18-208	ENST00000470089	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		41.62	■■■■■ 4.25
FBXO18-208	ENST00000470089	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	41.62	■■■■■ 4.25
FBXO18-208	ENST00000470089	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		41.61	■■■■■ 4.25
FBXO18-208	ENST00000470089	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		41.61	■■■■■ 4.25
FBXO18-208	ENST00000470089	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	41.61	■■■■■ 4.25
FBXO18-208	ENST00000470089	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	41.57	■■■■■ 4.25
FBXO18-208	ENST00000470089	USP21	Q9UK80	565 aa		41.57	■■■■■ 4.25
FBXO18-208	ENST00000470089	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	41.56	■■■■■ 4.24
FBXO18-208	ENST00000470089	RXRB	P28702	533 aa		41.55	■■■■■ 4.24

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