RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468018.5

ATG4B-215, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-215ENST00000468018 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-215ENST00000468018 STK26Q9P289 416 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-215ENST00000468018 SHPRHQ149N8 1683 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-215ENST00000468018 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-215ENST00000468018 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-215ENST00000468018 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-215ENST00000468018 ADGRB2O60241 1585 aa22.08■■□□□ 1.12
ATG4B-215ENST00000468018 JCADQ9P266 1359 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-215ENST00000468018 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ATG4B-215ENST00000468018 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-215ENST00000468018 PRAM1Q96QH2 718 aa22■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 ORAI2Q96SN7 254 aa22■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 USP32Q8NFA0 1604 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 KIF1AQ12756 1690 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.98■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 ILDR2Q71H61 639 aa21.98■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.98■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.97■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 LRP6O75581 1613 aa21.97■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.96■■□□□ 1.11
ATG4B-215ENST00000468018 PXDNQ92626 1479 aa21.95■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.93■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.92■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.92■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 POGKQ9P215 609 aa21.92■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.91■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.9■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 NEUROD1Q13562 356 aa21.9■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.9■■□□□ 1.1
ATG4B-215ENST00000468018 NUTM2FA1L443 756 aa21.88■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 ITSN1Q15811 1721 aa21.87■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.85■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.85■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 FOXO3O43524 673 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 ATP7BP35670 1465 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.83■■□□□ 1.09
ATG4B-215ENST00000468018 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
ATG4B-215ENST00000468018 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ATG4B-215ENST00000468018 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.82■■□□□ 1.08
ATG4B-215ENST00000468018 TONSLQ96HA7 1378 aa21.79■■□□□ 1.08
ATG4B-215ENST00000468018 ALS2Q96Q42 1657 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG4B-215ENST00000468018 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG4B-215ENST00000468018 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4B-215ENST00000468018 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ATG4B-215ENST00000468018 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
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ATG4B-215ENST00000468018 ABCA3Q99758 1704 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4B-215ENST00000468018 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 SBNO1A3KN83 1393 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.76■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 SOCS7O14512 581 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 CDK19Q9BWU1 502 aa21.73■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG4B-215ENST00000468018 PSME1Q06323 249 aa21.7■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 AFF2P51816 1311 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.68■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 ARHGEF10O15013 1369 aa21.67■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.67■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 ADAMTS2O95450 1211 aa21.65■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 C8orf37Q96NL8 207 aa21.65■■□□□ 1.06
ATG4B-215ENST00000468018 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.63■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.63■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 CABP2Q9NPB3 220 aa21.62■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 AKAP12Q02952 1782 aa21.61■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 ACEP12821 1306 aa21.61■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 SLIT2O94813 1529 aa21.61■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.61■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.61■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.6■■□□□ 1.05
ATG4B-215ENST00000468018 EVC2Q86UK5 1308 aa21.6■■□□□ 1.05
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