RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 WWC1Q8IX03 1113 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-207ENST00000462494 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-207ENST00000462494 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-207ENST00000462494 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-207ENST00000462494 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-207ENST00000462494 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-207ENST00000462494 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.02■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 EVC2Q86UK5 1308 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 DEKP35659 375 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 MTHFSP49914 203 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 RUNDC1Q96C34 613 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 GLI2P10070 1586 aa22■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 CABP2Q9NPB3 220 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 NEO1Q92859 1461 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 IDI1Q13907 227 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 BCL11AQ9H165 835 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 STK26Q9P289 416 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 SHPRHQ149N8 1683 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 RGS3P49796 1198 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 CFAP53Q96M91 514 aa21.97■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-207ENST00000462494 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 PIK3C2BO00750 1634 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 FAM161AQ3B820 660 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 PANK1Q8TE04 598 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 COG6Q9Y2V7 657 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 USP32Q8NFA0 1604 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 PDE3AQ14432 1141 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.13e-42■□□□□ 8.5
ACTB-207ENST00000462494 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 IGHDP01880 384 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 C8orf34Q49A92 452 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-207ENST00000462494 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 WDR63Q8IWG1 891 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 NSD2O96028 1365 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.87■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 RICTORQ6R327 1708 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.86■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 A0A1W2PP64 1363 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 PRAM1Q96QH2 718 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 POGKQ9P215 609 aa21.84■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 NEFMP07197 916 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 CCDC27Q2M243 656 aa21.83■■□□□ 1.09
ACTB-207ENST00000462494 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 SLC4A3P48751 1232 aa21.83■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 ZFYVE9O95405 1425 aa21.82■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 TNNQ9UQP3 1299 aa21.81■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 ABCC11Q96J66 1382 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.8■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 RLBP1P12271 317 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.79■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 PTPRMP28827 1452 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ACTB-207ENST00000462494 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 FYB1O15117 783 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 CDK19Q9BWU1 502 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 USP35Q9P2H5 1018 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 CABP1Q9NZU7 370 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 ADGRB2O60241 1585 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-207ENST00000462494 AAMPQ13685 434 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
ACTB-207ENST00000462494 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.69■■□□□ 1.06
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