RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAG1Q86YV5 1406 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 C14orf37Q86TY3 774 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 PHLPP1O60346 1717 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 PTCH1Q13635 1447 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 MST1RQ04912 1400 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRB1O14514 1584 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCC11Q96J66 1382 aa10.25□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 TECPR2O15040 1411 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 ATF3P18847 181 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 BRINP3Q76B58 766 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 LAMC1P11047 1609 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 DSG3P32926 999 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 DCCP43146 1447 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 NHSL1Q5SYE7 1610 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 NEUROD1Q13562 356 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 NBPF1Q3BBV0 1214 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 ILDR2Q71H61 639 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 ORAI2Q96SN7 254 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf167Q5SNV9 1468 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 NUTM2FA1L443 756 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXD4L1Q9NU39 408 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAK1Q9UPV9 953 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGEF1-206ENST00000461017 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP10.2□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 SIRT1Q96EB6 747 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 DLC1Q96QB1 1528 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 PRAM1Q96QH2 718 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 USP32Q8NFA0 1604 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 NBPF8Q3BBV2 869 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 STAC3Q96MF2 364 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 PCGF6Q9BYE7 350 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 SHPRHQ149N8 1683 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 LRP6O75581 1613 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGEF1-206ENST00000461017 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 POGKQ9P215 609 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRB2O60241 1585 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 JCADQ9P266 1359 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXO3O43524 673 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 PXDNQ92626 1479 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 PNPLA6Q8IY17 1366 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 WASLO00401 505 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 QRICH2Q9H0J4 1663 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 KIF1AQ12756 1690 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 POTEAQ6S8J7 498 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 CDK19Q9BWU1 502 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
RABGEF1-206ENST00000461017 TULP4Q9NRJ4 1543 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.08□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP7BP35670 1465 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 TONSLQ96HA7 1378 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC24A1O60721 1099 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 ITSN1Q15811 1721 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 ALS2Q96Q42 1657 aa10.06□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCA3Q99758 1704 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 GPRASP1Q5JY77 1395 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 CABP2Q9NPB3 220 aa10.05□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 RALGAPBQ86X10 1494 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB22O15209 634 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCB7O75027 752 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTS2O95450 1211 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHG5O94827 1062 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms