RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ACBD3Q9H3P7 528 aa18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MNS1Q8NEH6 495 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KIF21BO75037 1637 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PSMA5P28066 241 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VPS37DQ86XT2 251 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AK7Q96M32 723 aa18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGF1RP08069 1367 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WWC1Q8IX03 1113 aa18■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CNTROBQ8N137 903 aa17.99■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RUFY1Q96T51 708 aa17.99■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OLFM4Q6UX06 510 aa17.99■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDR1P51861 262 aa17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAD21O60216 631 aa17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBXW7Q969H0 707 aa17.98■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HMOX1P09601 288 aa17.97■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FOSBP53539 338 aa17.97■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa17.97■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRDM2Q13029 1718 aa17.96■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.96■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 BRMS1Q9HCU9 246 aa17.96■□□□□ 0.47
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RIC3Q7Z5B4 369 aa17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCAPERQ9BY12 1400 aa17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MBD3O95983 291 aa17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MSH5O43196 834 aa17.95■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WASHC2AQ641Q2 1341 aa17.94■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRAK2O60296 914 aa17.94■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.94■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.94■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NCOA2Q15596 1464 aa17.94■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MCM2P49736 904 aa17.94■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAP7D2Q96T17 732 aa17.93■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TSPY26PQ9H489 355 aa17.93■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSP90B2PQ58FF3 399 aa17.93■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 XBP1P17861 261 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATF3P18847 181 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WASHC4Q2M389 1173 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GGNBP2Q9H3C7 697 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GNAI3P08754 354 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NEUROD6Q96NK8 337 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RABEP1Q15276 862 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIP1O00291 1037 aa17.92■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GCC1Q96CN9 775 aa17.91■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FSD1Q9BTV5 496 aa17.91■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC30Q5VVM6 783 aa17.91■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC173Q0VFZ6 552 aa17.9■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CABP2Q9NPB3 220 aa17.9■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCP110O43303 1012 aa17.9■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PPP2R1AP30153 589 aa17.9■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.9■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa17.9■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.89■□□□□ 0.46
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDILTQ8N807 584 aa17.89■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SDF4Q9BRK5 362 aa17.89■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM69CQ0P6D2 419 aa17.88■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDE3AQ14432 1141 aa17.88■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GAS2L2Q8NHY3 880 aa17.88■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TCP11L2Q8N4U5 519 aa17.88■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MTHFSP49914 203 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNF214Q8ND24 703 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PDCP20941 246 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ERC1Q8IUD2 1116 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CAGE1Q8TC20 777 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRIM5Q9C035 493 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCDC27Q2M243 656 aa17.87■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPRASP1Q5JY77 1395 aa17.86■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EPS15P42566 896 aa17.86■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HFM1A2PYH4 1435 aa17.86■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KINO60870 393 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYNJ2O15056 1496 aa17.86■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SART3Q15020 963 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CDCA7LQ96GN5 454 aa17.85■□□□□ 0.45
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms