RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 TOM1O60784 492 aa29.27■■■□□ 2.28
PMS1-211ENST00000424766 DCCP43146 1447 aa29.25■■■□□ 2.27
PMS1-211ENST00000424766 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.24■■■□□ 2.27
PMS1-211ENST00000424766 ATF3P18847 181 aa29.24■■■□□ 2.27
PMS1-211ENST00000424766 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.24■■■□□ 2.27
PMS1-211ENST00000424766 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
PMS1-211ENST00000424766 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
PMS1-211ENST00000424766 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
PMS1-211ENST00000424766 FBXO41Q8TF61 875 aa29.18■■■□□ 2.26
PMS1-211ENST00000424766 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.17■■■□□ 2.26
PMS1-211ENST00000424766 SLAIN2Q9P270 581 aa29.16■■■□□ 2.26
PMS1-211ENST00000424766 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
PMS1-211ENST00000424766 ADGRB2O60241 1585 aa29.14■■■□□ 2.26
PMS1-211ENST00000424766 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.13■■■□□ 2.25
PMS1-211ENST00000424766 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
PMS1-211ENST00000424766 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.1■■■□□ 2.25
PMS1-211ENST00000424766 MST1RQ04912 1400 aa29.1■■■□□ 2.25
PMS1-211ENST00000424766 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
PMS1-211ENST00000424766 PIP4K2BP78356 416 aa29.08■■■□□ 2.25
PMS1-211ENST00000424766 USP47Q96K76 1375 aa29.07■■■□□ 2.24
PMS1-211ENST00000424766 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.05■■■□□ 2.24
PMS1-211ENST00000424766 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.05■■■□□ 2.24
PMS1-211ENST00000424766 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.04■■■□□ 2.24
PMS1-211ENST00000424766 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PMS1-211ENST00000424766 SLC24A1O60721 1099 aa29.04■■■□□ 2.24
PMS1-211ENST00000424766 CDK19Q9BWU1 502 aa29.03■■■□□ 2.24
PMS1-211ENST00000424766 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PMS1-211ENST00000424766 EVC2Q86UK5 1308 aa29.01■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.01■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 NUTM2FA1L443 756 aa29■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.99■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 BRINP3Q76B58 766 aa28.98■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 TESK2Q96S53 571 aa28.98■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 ORAI2Q96SN7 254 aa28.97■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 USP32Q8NFA0 1604 aa28.96■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.96■■■□□ 2.23
PMS1-211ENST00000424766 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
PMS1-211ENST00000424766 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PMS1-211ENST00000424766 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.94■■■□□ 2.22
PMS1-211ENST00000424766 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PMS1-211ENST00000424766 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PMS1-211ENST00000424766 CABP2Q9NPB3 220 aa28.91■■■□□ 2.22
PMS1-211ENST00000424766 ITSN1Q15811 1721 aa28.91■■■□□ 2.22
PMS1-211ENST00000424766 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
PMS1-211ENST00000424766 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.9■■■□□ 2.22
PMS1-211ENST00000424766 ATP7BP35670 1465 aa28.9■■■□□ 2.22
PMS1-211ENST00000424766 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.89■■■□□ 2.22
PMS1-211ENST00000424766 KIF1AQ12756 1690 aa28.89■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 TMF1P82094 1093 aa28.88■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.87■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 HSPA1LP34931 641 aa28.85■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.85■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 PHLPP1O60346 1717 aa28.85■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.84■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.83■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 FOXO3O43524 673 aa28.83■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.83■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.83■■■□□ 2.21
PMS1-211ENST00000424766 CDCA8Q53HL2 280 aa28.82■■■□□ 2.2
PMS1-211ENST00000424766 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.8■■■□□ 2.2
PMS1-211ENST00000424766 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
PMS1-211ENST00000424766 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.79■■■□□ 2.2
PMS1-211ENST00000424766 CABP1Q9NZU7 370 aa28.79■■■□□ 2.2
PMS1-211ENST00000424766 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
PMS1-211ENST00000424766 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
PMS1-211ENST00000424766 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.2
PMS1-211ENST00000424766 PSME1Q06323 249 aa28.76■■■□□ 2.19
PMS1-211ENST00000424766 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.76■■■□□ 2.19
PMS1-211ENST00000424766 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PMS1-211ENST00000424766 ACEP12821 1306 aa28.75■■■□□ 2.19
PMS1-211ENST00000424766 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
PMS1-211ENST00000424766 PXDNQ92626 1479 aa28.73■■■□□ 2.19
PMS1-211ENST00000424766 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.71■■■□□ 2.19
PMS1-211ENST00000424766 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 TMC1Q8TDI8 760 aa28.7■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.69■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 AKAP12Q02952 1782 aa28.67■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 SBNO1A3KN83 1393 aa28.67■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 JCADQ9P266 1359 aa28.65■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.65■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.64■■■□□ 2.18
PMS1-211ENST00000424766 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
PMS1-211ENST00000424766 SHPRHQ149N8 1683 aa28.62■■■□□ 2.17
PMS1-211ENST00000424766 USP6P35125 1406 aa28.61■■■□□ 2.17
PMS1-211ENST00000424766 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.61■■■□□ 2.17
PMS1-211ENST00000424766 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.6■■■□□ 2.17
PMS1-211ENST00000424766 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.6■■■□□ 2.17
PMS1-211ENST00000424766 MYOM1P52179 1685 aa28.59■■■□□ 2.17
PMS1-211ENST00000424766 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
PMS1-211ENST00000424766 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.59■■■□□ 2.17
PMS1-211ENST00000424766 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.58■■■□□ 2.17
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