RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424161.5

TTC28-AS1-204, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 556 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMEM94Q12767 1356 aa18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TESK2Q96S53 571 aa18.86■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NALCNQ8IZF0 1738 aa18.85■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-204ENST00000424161 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa18.83■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DCCP43146 1447 aa18.83■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TULP4Q9NRJ4 1543 aa18.81■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C14orf37Q86TY3 774 aa18.81■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.81■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MSH6P52701 1360 aa18.81■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EVC2Q86UK5 1308 aa18.8■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMF1P82094 1093 aa18.8■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.78■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WASLO00401 505 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CDCA8Q53HL2 280 aa18.77■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.77■□□□□ 0.6
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FMN2Q9NZ56 1722 aa18.76■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CDK19Q9BWU1 502 aa18.75■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ANKARQ7Z5J8 1434 aa18.74■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ATF3P18847 181 aa18.74■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ATAD2Q6PL18 1390 aa18.72■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ATP7BP35670 1465 aa18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MST1RQ04912 1400 aa18.7■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CERKQ8TCT0 537 aa18.7■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CABP2Q9NPB3 220 aa18.7■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.7■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC7Q96M83 1385 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP32Q8NFA0 1604 aa18.69■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C1orf167Q5SNV9 1468 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ITSN1Q15811 1721 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.68■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NUTM2FA1L443 756 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC61Q9Y6R9 512 aa18.66■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MYOM1P52179 1685 aa18.65■□□□□ 0.58
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLAIN2Q9P270 581 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa18.64■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TOM1O60784 492 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.63■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIF1AQ12756 1690 aa18.62■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PLEKHG3A1L390 1219 aa18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ESCO1Q5FWF5 840 aa18.61■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMC1Q8TDI8 760 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CABP1Q9NZU7 370 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PHF8Q9UPP1 1060 aa18.6■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ORAI2Q96SN7 254 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa18.59■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.58■□□□□ 0.57
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BRINP3Q76B58 766 aa18.58■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.57■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TERF2IPQ9NYB0 399 aa18.57■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CD163L1Q9NR16 1453 aa18.57■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ACEP12821 1306 aa18.56■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.56■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AKAP12Q02952 1782 aa18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 A0A1W2PP64 1363 aa18.55■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NPHP3Q7Z494 1330 aa18.53■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.52■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP6P35125 1406 aa18.52■□□□□ 0.56
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NHSL1Q5SYE7 1610 aa18.52■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FOXO3O43524 673 aa18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PANK3Q9H999 370 aa18.51■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.5■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PIP4K2BP78356 416 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PSME1Q06323 249 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PXDNQ92626 1479 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SSH2Q76I76 1423 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NSD3Q9BZ95 1437 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CARD14Q9BXL6 1004 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SBNO1A3KN83 1393 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms