RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416849.6

TBXAS1-204, Transcript of thromboxane A synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TBXAS1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBXAS1-204ENST00000416849 PDE3AQ14432 1141 aa23.1■■□□□ 1.29
TBXAS1-204ENST00000416849 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TBXAS1-204ENST00000416849 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.09■■□□□ 1.29
TBXAS1-204ENST00000416849 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.09■■□□□ 1.29
TBXAS1-204ENST00000416849 ABCA6Q8N139 1617 aa23.09■■□□□ 1.29
TBXAS1-204ENST00000416849 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.08■■□□□ 1.29
TBXAS1-204ENST00000416849 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.08■■□□□ 1.29
TBXAS1-204ENST00000416849 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
TBXAS1-204ENST00000416849 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.07■■□□□ 1.28
TBXAS1-204ENST00000416849 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.07■■□□□ 1.28
TBXAS1-204ENST00000416849 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.07■■□□□ 1.28
TBXAS1-204ENST00000416849 GGT6Q6P531 493 aa23.04■■□□□ 1.28
TBXAS1-204ENST00000416849 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TBXAS1-204ENST00000416849 SYNMO15061 1565 aa23.03■■□□□ 1.28
TBXAS1-204ENST00000416849 MYOM1P52179 1685 aa23.03■■□□□ 1.28
TBXAS1-204ENST00000416849 CDCA8Q53HL2 280 aa23.02■■□□□ 1.28
TBXAS1-204ENST00000416849 MADDQ8WXG6 1647 aa23.02■■□□□ 1.28
TBXAS1-204ENST00000416849 IQGAP1P46940 1657 aa23.02■■□□□ 1.28
TBXAS1-204ENST00000416849 DEPDC5O75140 1603 aa23.01■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.01■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 ATP10AO60312 1499 aa22.99■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 MCM4P33991 863 aa22.99■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.98■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 FSD2A1L4K1 749 aa22.96■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.96■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.96■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.96■■□□□ 1.27
TBXAS1-204ENST00000416849 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TBXAS1-204ENST00000416849 KANK1Q14678 1352 aa22.94■■□□□ 1.26
TBXAS1-204ENST00000416849 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.94■■□□□ 1.26
TBXAS1-204ENST00000416849 CEP152O94986 1710 aa22.94■■□□□ 1.26
TBXAS1-204ENST00000416849 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.93■■□□□ 1.26
TBXAS1-204ENST00000416849 TRAK2O60296 914 aa22.92■■□□□ 1.26
TBXAS1-204ENST00000416849 ERVK-7P63135 1459 aa22.91■■□□□ 1.26
TBXAS1-204ENST00000416849 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.9■■□□□ 1.26
TBXAS1-204ENST00000416849 TET3O43151 1660 aa22.9■■□□□ 1.26
TBXAS1-204ENST00000416849 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.89■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.88■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 MORC1Q86VD1 984 aa22.87■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.87■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 RUNDC1Q96C34 613 aa22.86■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.85■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 ERBB4Q15303 1308 aa22.85■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.85■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.85■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 CLTCL1P53675 1640 aa22.84■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 CLCN1P35523 988 aa22.84■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.84■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 MTHFSP49914 203 aa22.83■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 MLECQ14165 292 aa22.83■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TBXAS1-204ENST00000416849 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.82■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.82■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 NGEFQ8N5V2 710 aa22.81■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.8■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 NPATQ14207 1427 aa22.8■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 SHPRHQ149N8 1683 aa22.8■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.79■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 ABCC3O15438 1527 aa22.79■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 PTPRTO14522 1441 aa22.79■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 TRPM2O94759 1503 aa22.78■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.78■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.78■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.78■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 WDR63Q8IWG1 891 aa22.77■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 MRE11P49959 708 aa22.77■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.77■■□□□ 1.24
TBXAS1-204ENST00000416849 TRIM27P14373 513 aa22.76■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.76■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.76■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.75■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 HSCBQ8IWL3 235 aa22.74■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.74■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.74■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.73■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 ESPNB1AK53 854 aa22.72■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.72■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.72■■□□□ 1.23
TBXAS1-204ENST00000416849 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.9 ms