RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395564.8

UPP1-203, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-203ENST00000395564 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
UPP1-203ENST00000395564 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
UPP1-203ENST00000395564 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.5■■□□□ 1.67
UPP1-203ENST00000395564 TOM1O60784 492 aa25.49■■□□□ 1.67
UPP1-203ENST00000395564 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
UPP1-203ENST00000395564 ATF3P18847 181 aa25.48■■□□□ 1.67
UPP1-203ENST00000395564 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.47■■□□□ 1.67
UPP1-203ENST00000395564 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
UPP1-203ENST00000395564 ADGRB2O60241 1585 aa25.46■■□□□ 1.67
UPP1-203ENST00000395564 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.45■■□□□ 1.67
UPP1-203ENST00000395564 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.42■■□□□ 1.66
UPP1-203ENST00000395564 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
UPP1-203ENST00000395564 USP47Q96K76 1375 aa25.41■■□□□ 1.66
UPP1-203ENST00000395564 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.41■■□□□ 1.66
UPP1-203ENST00000395564 SLAIN2Q9P270 581 aa25.4■■□□□ 1.66
UPP1-203ENST00000395564 FBXO41Q8TF61 875 aa25.39■■□□□ 1.65
UPP1-203ENST00000395564 MST1RQ04912 1400 aa25.39■■□□□ 1.65
UPP1-203ENST00000395564 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
UPP1-203ENST00000395564 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.37■■□□□ 1.65
UPP1-203ENST00000395564 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
UPP1-203ENST00000395564 SLC24A1O60721 1099 aa25.37■■□□□ 1.65
UPP1-203ENST00000395564 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
UPP1-203ENST00000395564 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.35■■□□□ 1.65
UPP1-203ENST00000395564 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.34■■□□□ 1.65
UPP1-203ENST00000395564 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.33■■□□□ 1.65
UPP1-203ENST00000395564 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
UPP1-203ENST00000395564 EVC2Q86UK5 1308 aa25.31■■□□□ 1.64
UPP1-203ENST00000395564 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.31■■□□□ 1.64
UPP1-203ENST00000395564 PIP4K2BP78356 416 aa25.31■■□□□ 1.64
UPP1-203ENST00000395564 CDK19Q9BWU1 502 aa25.31■■□□□ 1.64
UPP1-203ENST00000395564 TESK2Q96S53 571 aa25.3■■□□□ 1.64
UPP1-203ENST00000395564 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.28■■□□□ 1.64
UPP1-203ENST00000395564 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
UPP1-203ENST00000395564 BRINP3Q76B58 766 aa25.27■■□□□ 1.64
UPP1-203ENST00000395564 USP32Q8NFA0 1604 aa25.27■■□□□ 1.64
UPP1-203ENST00000395564 NUTM2FA1L443 756 aa25.26■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 ATP7BP35670 1465 aa25.25■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.24■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.24■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 ORAI2Q96SN7 254 aa25.23■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 ITSN1Q15811 1721 aa25.22■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 TMF1P82094 1093 aa25.21■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 CABP2Q9NPB3 220 aa25.21■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.21■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 KIF1AQ12756 1690 aa25.21■■□□□ 1.63
UPP1-203ENST00000395564 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.19■■□□□ 1.62
UPP1-203ENST00000395564 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UPP1-203ENST00000395564 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.18■■□□□ 1.62
UPP1-203ENST00000395564 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.18■■□□□ 1.62
UPP1-203ENST00000395564 CDCA8Q53HL2 280 aa25.18■■□□□ 1.62
UPP1-203ENST00000395564 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.17■■□□□ 1.62
UPP1-203ENST00000395564 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.15■■□□□ 1.62
UPP1-203ENST00000395564 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.15■■□□□ 1.62
UPP1-203ENST00000395564 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.15■■□□□ 1.62
UPP1-203ENST00000395564 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.13■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.12■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 PHLPP1O60346 1717 aa25.11■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 FOXO3O43524 673 aa25.11■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 HSPA1LP34931 641 aa25.11■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.1■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 CABP1Q9NZU7 370 aa25.09■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
UPP1-203ENST00000395564 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
UPP1-203ENST00000395564 PXDNQ92626 1479 aa25.07■■□□□ 1.6
UPP1-203ENST00000395564 ACEP12821 1306 aa25.06■■□□□ 1.6
UPP1-203ENST00000395564 PSME1Q06323 249 aa25.05■■□□□ 1.6
UPP1-203ENST00000395564 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.05■■□□□ 1.6
UPP1-203ENST00000395564 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
UPP1-203ENST00000395564 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
UPP1-203ENST00000395564 TMC1Q8TDI8 760 aa25.03■■□□□ 1.6
UPP1-203ENST00000395564 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
UPP1-203ENST00000395564 SBNO1A3KN83 1393 aa25.02■■□□□ 1.6
UPP1-203ENST00000395564 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.01■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 AKAP12Q02952 1782 aa24.99■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 JCADQ9P266 1359 aa24.99■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.98■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 USP6P35125 1406 aa24.98■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.98■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 MYOM1P52179 1685 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.96■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.95■■□□□ 1.59
UPP1-203ENST00000395564 SHPRHQ149N8 1683 aa24.95■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
UPP1-203ENST00000395564 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms