RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367760.7

PRRX1-202, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-202ENST00000367760 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 MORC1Q86VD1 984 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.31■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 SLFN5Q08AF3 891 aa22.29■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.28■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 APAF1O14727 1248 aa22.26■■□□□ 1.15
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRX1-202ENST00000367760 E9PSI1 815 aa22.25■■□□□ 1.15
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PRRX1-202ENST00000367760 CFAP53Q96M91 514 aa22.22■■□□□ 1.15
PRRX1-202ENST00000367760 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.22■■□□□ 1.15
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PRRX1-202ENST00000367760 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.19■■□□□ 1.14
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PRRX1-202ENST00000367760 STK26Q9P289 416 aa22.16■■□□□ 1.14
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PRRX1-202ENST00000367760 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.14■■□□□ 1.14
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PRRX1-202ENST00000367760 MED14O60244 1454 aa22.14■■□□□ 1.14
PRRX1-202ENST00000367760 DLC1Q96QB1 1528 aa22.14■■□□□ 1.13
PRRX1-202ENST00000367760 A0A1W2PP64 1363 aa22.14■■□□□ 1.13
PRRX1-202ENST00000367760 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.13■■□□□ 1.13
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PRRX1-202ENST00000367760 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
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PRRX1-202ENST00000367760 NLRP1Q9C000 1473 aa22.02■■□□□ 1.12
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PRRX1-202ENST00000367760 SIRT1Q96EB6 747 aa21.95■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.95■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.94■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PRRX1-202ENST00000367760 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
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