RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325139.9

CYTH2-201, Transcript of cytohesin 2, humanhuman

TSL 2

Gene CYTH2, Length 1,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH2-201ENST00000325139 ADGRB2O60241 1585 aa36.75■■■■□ 3.47
CYTH2-201ENST00000325139 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CYTH2-201ENST00000325139 LRP6O75581 1613 aa36.74■■■■□ 3.47
CYTH2-201ENST00000325139 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.72■■■■□ 3.47
CYTH2-201ENST00000325139 SIRT1Q96EB6 747 aa36.72■■■■□ 3.47
CYTH2-201ENST00000325139 STK26Q9P289 416 aa36.71■■■■□ 3.47
CYTH2-201ENST00000325139 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
CYTH2-201ENST00000325139 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.68■■■■□ 3.46
CYTH2-201ENST00000325139 STAC3Q96MF2 364 aa36.68■■■■□ 3.46
CYTH2-201ENST00000325139 USP32Q8NFA0 1604 aa36.67■■■■□ 3.46
CYTH2-201ENST00000325139 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
CYTH2-201ENST00000325139 KIF1AQ12756 1690 aa36.62■■■■□ 3.45
CYTH2-201ENST00000325139 ORAI2Q96SN7 254 aa36.61■■■■□ 3.45
CYTH2-201ENST00000325139 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
CYTH2-201ENST00000325139 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
CYTH2-201ENST00000325139 PXDNQ92626 1479 aa36.59■■■■□ 3.45
CYTH2-201ENST00000325139 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.59■■■■□ 3.45
CYTH2-201ENST00000325139 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
CYTH2-201ENST00000325139 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.57■■■■□ 3.44
CYTH2-201ENST00000325139 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.54■■■■□ 3.44
CYTH2-201ENST00000325139 PRAM1Q96QH2 718 aa36.52■■■■□ 3.44
CYTH2-201ENST00000325139 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.52■■■■□ 3.44
CYTH2-201ENST00000325139 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
CYTH2-201ENST00000325139 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CYTH2-201ENST00000325139 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.44■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.44■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.43■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.43■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 SOCS7O14512 581 aa36.41■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.4■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.4■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.4■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CYTH2-201ENST00000325139 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.38■■■■□ 3.41
CYTH2-201ENST00000325139 NUTM2FA1L443 756 aa36.38■■■■□ 3.41
CYTH2-201ENST00000325139 ITSN1Q15811 1721 aa36.37■■■■□ 3.41
CYTH2-201ENST00000325139 POTEAQ6S8J7 498 aa36.36■■■■□ 3.41
CYTH2-201ENST00000325139 ABCA3Q99758 1704 aa36.35■■■■□ 3.41
CYTH2-201ENST00000325139 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.35■■■■□ 3.41
CYTH2-201ENST00000325139 ATP7BP35670 1465 aa36.34■■■■□ 3.41
CYTH2-201ENST00000325139 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.34■■■■□ 3.41
CYTH2-201ENST00000325139 POGKQ9P215 609 aa36.33■■■■□ 3.41
CYTH2-201ENST00000325139 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.32■■■■□ 3.41
CYTH2-201ENST00000325139 FOXO3O43524 673 aa36.31■■■■□ 3.4
CYTH2-201ENST00000325139 ALS2Q96Q42 1657 aa36.29■■■■□ 3.4
CYTH2-201ENST00000325139 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
CYTH2-201ENST00000325139 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
CYTH2-201ENST00000325139 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa36.25■■■■□ 3.39
CYTH2-201ENST00000325139 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
CYTH2-201ENST00000325139 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
CYTH2-201ENST00000325139 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.24■■■■□ 3.39
CYTH2-201ENST00000325139 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
CYTH2-201ENST00000325139 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
CYTH2-201ENST00000325139 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
CYTH2-201ENST00000325139 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
CYTH2-201ENST00000325139 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.22■■■■□ 3.39
CYTH2-201ENST00000325139 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.21■■■■□ 3.39
CYTH2-201ENST00000325139 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.19■■■■□ 3.38
CYTH2-201ENST00000325139 NEUROD1Q13562 356 aa36.19■■■■□ 3.38
CYTH2-201ENST00000325139 SBNO1A3KN83 1393 aa36.18■■■■□ 3.38
CYTH2-201ENST00000325139 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
CYTH2-201ENST00000325139 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
CYTH2-201ENST00000325139 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.15■■■■□ 3.38
CYTH2-201ENST00000325139 AFF2P51816 1311 aa36.13■■■■□ 3.37
CYTH2-201ENST00000325139 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.13■■■■□ 3.37
CYTH2-201ENST00000325139 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.12■■■■□ 3.37
CYTH2-201ENST00000325139 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
CYTH2-201ENST00000325139 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.09■■■■□ 3.37
CYTH2-201ENST00000325139 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
CYTH2-201ENST00000325139 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
CYTH2-201ENST00000325139 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.07■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 C8orf37Q96NL8 207 aa36.06■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 ADAMTS2O95450 1211 aa36.04■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 CDK19Q9BWU1 502 aa36.04■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.02■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 NWD2Q9ULI1 1742 aa36.02■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 SLIT2O94813 1529 aa36.02■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 ARHGEF10O15013 1369 aa36.02■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
CYTH2-201ENST00000325139 TONSLQ96HA7 1378 aa36■■■■□ 3.35
CYTH2-201ENST00000325139 ATRNO75882 1429 aa36■■■■□ 3.35
CYTH2-201ENST00000325139 PSME1Q06323 249 aa35.99■■■■□ 3.35
CYTH2-201ENST00000325139 NRAPQ86VF7 1730 aa35.98■■■■□ 3.35
CYTH2-201ENST00000325139 RGS12O14924 1447 aa35.95■■■■□ 3.35
CYTH2-201ENST00000325139 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.95■■■■□ 3.35
CYTH2-201ENST00000325139 AKAP12Q02952 1782 aa35.94■■■■□ 3.34
CYTH2-201ENST00000325139 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.93■■■■□ 3.34
CYTH2-201ENST00000325139 NGLY1Q96IV0 654 aa35.92■■■■□ 3.34
CYTH2-201ENST00000325139 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.92■■■■□ 3.34
CYTH2-201ENST00000325139 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.91■■■■□ 3.34
CYTH2-201ENST00000325139 GLI3P10071 1580 aa35.9■■■■□ 3.34
CYTH2-201ENST00000325139 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.89■■■■□ 3.34
CYTH2-201ENST00000325139 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms