RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320631.7

EHD1-201, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD1, Length 4,551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-201ENST00000320631 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
EHD1-201ENST00000320631 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.03■□□□□ -0
EHD1-201ENST00000320631 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
EHD1-201ENST00000320631 TRERF1Q96PN7 1200 aa15.03■□□□□ -0
EHD1-201ENST00000320631 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.02■□□□□ -0
EHD1-201ENST00000320631 LEKR1Q6ZMV7 388 aa15.02■□□□□ -0
EHD1-201ENST00000320631 NGEFQ8N5V2 710 aa15.02■□□□□ -0
EHD1-201ENST00000320631 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
EHD1-201ENST00000320631 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa15.02■□□□□ -0
EHD1-201ENST00000320631 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.02□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.02□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 AAMPQ13685 434 aa15.01□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.01□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.01□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 TOMM22Q9NS69 142 aa15.01□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 ARAP1Q96P48 1450 aa15.01□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 RDXP35241 583 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 RUFY1Q96T51 708 aa15□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 FOSBP53539 338 aa15□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 TAF3Q5VWG9 929 aa15□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 FMNL2Q96PY5 1086 aa15□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 SDF4Q9BRK5 362 aa15□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 AMPHP49418 695 aa15□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 RABEP1Q15276 862 aa14.99□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.99□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 34.3
EHD1-201ENST00000320631 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 RIPK4P57078 832 aa14.98□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.98□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 AK7Q96M32 723 aa14.98□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 PDE3AQ14432 1141 aa14.98□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 PDILTQ8N807 584 aa14.98□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 CLCN1P35523 988 aa14.97□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 RUNDC1Q96C34 613 aa14.97□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.97□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 SYCE3A1L190 88 aa14.97□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.97□□□□□ -0.01
EHD1-201ENST00000320631 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.96□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 CEP89Q96ST8 783 aa14.95□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.95□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 SMC2O95347 1197 aa14.94□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 PANK2Q9BZ23 570 aa14.94□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 DEF6Q9H4E7 631 aa14.94□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.94□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.94□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 CPLX1O14810 134 aa14.93□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 CCDC192P0DO97 292 aa14.93□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.93□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.92□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.92□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.92□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 RNF20Q5VTR2 975 aa14.92□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.92□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa14.92□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.91□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.91□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 NECTIN2Q92692 538 aa14.91□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 MARCH6O60337 910 aa14.91□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 MCM2P49736 904 aa14.91□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 KINO60870 393 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 NUTM2FA1L443 756 aa14.9□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.9□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
EHD1-201ENST00000320631 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 GRIN2BQ13224 1484 aa14.89□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.89□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.88□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 EVC2Q86UK5 1308 aa14.88□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 COG3Q96JB2 828 aa14.88□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.88□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 TRIM29Q14134 588 aa14.88□□□□□ -0.03
EHD1-201ENST00000320631 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms