RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-201ENST00000311008 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.55■■□□□ 1.68
SPNS1-201ENST00000311008 PDE4AP27815 886 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-201ENST00000311008 IDI1Q13907 227 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-201ENST00000311008 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-201ENST00000311008 BACH2Q9BYV9 841 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-201ENST00000311008 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-201ENST00000311008 BCL11AQ9H165 835 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS1-201ENST00000311008 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP53Q96M91 514 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-201ENST00000311008 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.5■■□□□ 1.67
SPNS1-201ENST00000311008 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.5■■□□□ 1.67
SPNS1-201ENST00000311008 SHPRHQ149N8 1683 aa25.5■■□□□ 1.67
SPNS1-201ENST00000311008 RUNDC1Q96C34 613 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-201ENST00000311008 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-201ENST00000311008 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-201ENST00000311008 WWC1Q8IX03 1113 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-201ENST00000311008 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.46■■□□□ 1.67
SPNS1-201ENST00000311008 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.45■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 MTHFSP49914 203 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 PDE3AQ14432 1141 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC27Q2M243 656 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 WDR63Q8IWG1 891 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 CABP2Q9NPB3 220 aa25.39■■□□□ 1.66
SPNS1-201ENST00000311008 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.39■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 ABCC11Q96J66 1382 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 BCAR3O75815 825 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 REREQ9P2R6 1566 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 PTPRMP28827 1452 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.36■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PP64 1363 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 STK26Q9P289 416 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 AGLP35573 1532 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 AAMPQ13685 434 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 MED14O60244 1454 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-201ENST00000311008 POGKQ9P215 609 aa25.32■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.31■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 DIP2BQ9P265 1576 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 NEUROD2Q15784 382 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 PRAM1Q96QH2 718 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 ALKQ9UM73 1620 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 FAM161AQ3B820 660 aa25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 ADGRB2O60241 1585 aa25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 SKAP1Q86WV1 359 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 DLC1Q96QB1 1528 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.22■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 FYB1O15117 783 aa25.22■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
SPNS1-201ENST00000311008 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 NLRP1Q9C000 1473 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 CDK19Q9BWU1 502 aa25.2■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 PANK1Q8TE04 598 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 COG6Q9Y2V7 657 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 NBR1Q14596 966 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 C8orf34Q49A92 452 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.17■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-201ENST00000311008 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.15■■□□□ 1.62
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