RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.34□□□□□ -0.59
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PDCL2-201ENST00000295645 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
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PDCL2-201ENST00000295645 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.33□□□□□ -0.6
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PDCL2-201ENST00000295645 PRR20CP86479 221 aa11.32□□□□□ -0.6
PDCL2-201ENST00000295645 PRR20DP86480 221 aa11.32□□□□□ -0.6
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PDCL2-201ENST00000295645 PRR20AP86496 221 aa11.32□□□□□ -0.6
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PDCL2-201ENST00000295645 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.3□□□□□ -0.6
PDCL2-201ENST00000295645 PRDM9Q9NQV7 894 aa11.3□□□□□ -0.6
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PDCL2-201ENST00000295645 C6orf229H3BNL8 230 aa11.25□□□□□ -0.61
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PDCL2-201ENST00000295645 GDF9O60383 454 aa11.24□□□□□ -0.61
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PDCL2-201ENST00000295645 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
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PDCL2-201ENST00000295645 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL2-201ENST00000295645 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PDCL2-201ENST00000295645 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.19□□□□□ -0.62
PDCL2-201ENST00000295645 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.19□□□□□ -0.62
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PDCL2-201ENST00000295645 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.17□□□□□ -0.62
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PDCL2-201ENST00000295645 FAM187AA6NFU0 413 aa11.11□□□□□ -0.63
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PDCL2-201ENST00000295645 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PDCL2-201ENST00000295645 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.1□□□□□ -0.63
PDCL2-201ENST00000295645 KCNH2Q12809 1159 aa11.09□□□□□ -0.63
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PDCL2-201ENST00000295645 MYT1Q01538 1121 aa11.08□□□□□ -0.64
PDCL2-201ENST00000295645 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.08□□□□□ -0.64
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PDCL2-201ENST00000295645 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PDCL2-201ENST00000295645 LILRB3O75022 631 aa11.07□□□□□ -0.64
PDCL2-201ENST00000295645 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
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PDCL2-201ENST00000295645 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
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PDCL2-201ENST00000295645 QPCTQ16769 361 aa11.01□□□□□ -0.65
PDCL2-201ENST00000295645 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.01□□□□□ -0.65
PDCL2-201ENST00000295645 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.01□□□□□ -0.65
PDCL2-201ENST00000295645 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PDCL2-201ENST00000295645 EHBP1Q8NDI1 1231 aa11□□□□□ -0.65
PDCL2-201ENST00000295645 SH3BP2P78314 561 aa10.99□□□□□ -0.65
PDCL2-201ENST00000295645 ZNF787Q6DD87 383 aa10.99□□□□□ -0.65
PDCL2-201ENST00000295645 FAM117AQ9C073 453 aa10.99□□□□□ -0.65
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