RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.92■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 ERC2O15083 957 aa24.91■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.91■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.9■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 NECTIN2Q92692 538 aa24.9■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.9■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
LRIG1-201ENST00000273261 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.89■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 PANK1Q8TE04 598 aa24.89■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 PDE3AQ14432 1141 aa24.88■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.87■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 SLC4A3P48751 1232 aa24.86■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 GNAI3P08754 354 aa24.86■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 PRKAR2BP31323 418 aa24.86■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 LNPKQ9C0E8 428 aa24.86■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.85■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.85■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.85■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 GSE1Q14687 1217 aa24.85■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.84■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 CDC45O75419 566 aa24.83■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.83■■□□□ 1.57
LRIG1-201ENST00000273261 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.83■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.82■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 CDK19Q9BWU1 502 aa24.82■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.82■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 NUCB2P80303 420 aa24.82■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 WDR63Q8IWG1 891 aa24.82■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.82■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.82■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 ABTB2Q8N961 1025 aa24.82■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.82■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 WDR97A6NE52 1622 aa24.8■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 GRIN2AQ12879 1464 aa24.79■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 KIF14Q15058 1648 aa24.79■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 ARHGEF11O15085 1522 aa24.79■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 TRDNQ13061 729 aa24.79■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.78■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 MARCH6O60337 910 aa24.78■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM29Q14134 588 aa24.78■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.77■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
LRIG1-201ENST00000273261 CPLX1O14810 134 aa24.76■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 CABP1Q9NZU7 370 aa24.76■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.76■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.76■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 GCC1Q96CN9 775 aa24.76■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 ABCC5O15440 1437 aa24.76■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 AKNAQ7Z591 1439 aa24.75■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 BECN2A8MW95 431 aa24.75■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 MCTP1Q6DN14 999 aa24.74■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.74■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.74■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 RAPGEF3O95398 923 aa24.73■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 APPP05067 770 aa24.73■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 WWC1Q8IX03 1113 aa24.72■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.72■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 TPM3P06753 285 aa24.72■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 VPS37DQ86XT2 251 aa24.72■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 CNTROBQ8N137 903 aa24.71■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.71■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF428Q96B54 188 aa24.7■■□□□ 1.55
LRIG1-201ENST00000273261 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.68■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.67■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.67■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 ERICH2A1L162 156 aa24.67■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 PSMA5P28066 241 aa24.67■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 GNAI2P04899 355 aa24.66■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 FCHSD2O94868 740 aa24.66■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 HIP1O00291 1037 aa24.66■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.66■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 TPM1P09493 284 aa24.65■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 TPM2P07951 284 aa24.65■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.65■■□□□ 1.54
LRIG1-201ENST00000273261 CD109Q6YHK3 1445 aa24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms